Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

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Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tgm1Q9JLF6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Tgm1Q9JLF6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tgm1Q9JLF6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tgm1Q9JLF6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tgm1Q9JLF6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tgm1Q9JLF6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tgm1Q9JLF6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tgm1Q9JLF6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Tgm1Q9JLF6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tgm1Q9JLF6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tgm1Q9JLF6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tgm1Q9JLF6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tgm1Q9JLF6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tgm1Q9JLF6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tgm1Q9JLF6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tgm1Q9JLF6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tgm1Q9JLF6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tgm1Q9JLF6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tgm1Q9JLF6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tgm1Q9JLF6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Tgm1Q9JLF6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tgm1Q9JLF6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tgm1Q9JLF6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tgm1Q9JLF6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tgm1Q9JLF6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tgm1Q9JLF6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tgm1Q9JLF6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tgm1Q9JLF6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tgm1Q9JLF6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tgm1Q9JLF6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Tgm1Q9JLF6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tgm1Q9JLF6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tgm1Q9JLF6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tgm1Q9JLF6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tgm1Q9JLF6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tgm1Q9JLF6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tgm1Q9JLF6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tgm1Q9JLF6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tgm1Q9JLF6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tgm1Q9JLF6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tgm1Q9JLF6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tgm1Q9JLF6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tgm1Q9JLF6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tgm1Q9JLF6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tgm1Q9JLF6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tgm1Q9JLF6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tgm1Q9JLF6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Tgm1Q9JLF6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tgm1Q9JLF6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tgm1Q9JLF6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tgm1Q9JLF6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tgm1Q9JLF6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Tgm1Q9JLF6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tgm1Q9JLF6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tgm1Q9JLF6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tgm1Q9JLF6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tgm1Q9JLF6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tgm1Q9JLF6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tgm1Q9JLF6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tgm1Q9JLF6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tgm1Q9JLF6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tgm1Q9JLF6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Tgm1Q9JLF6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tgm1Q9JLF6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tgm1Q9JLF6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tgm1Q9JLF6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tgm1Q9JLF6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tgm1Q9JLF6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tgm1Q9JLF6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Tgm1Q9JLF6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tgm1Q9JLF6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tgm1Q9JLF6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tgm1Q9JLF6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tgm1Q9JLF6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Tgm1Q9JLF6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tgm1Q9JLF6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tgm1Q9JLF6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tgm1Q9JLF6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tgm1Q9JLF6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tgm1Q9JLF6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tgm1Q9JLF6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tgm1Q9JLF6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tgm1Q9JLF6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tgm1Q9JLF6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tgm1Q9JLF6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tgm1Q9JLF6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tgm1Q9JLF6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tgm1Q9JLF6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tgm1Q9JLF6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tgm1Q9JLF6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tgm1Q9JLF6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tgm1Q9JLF6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tgm1Q9JLF6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tgm1Q9JLF6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Tgm1Q9JLF6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tgm1Q9JLF6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tgm1Q9JLF6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tgm1Q9JLF6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tgm1Q9JLF6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms