Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL18

Bace2, Beta-secretase 2, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace2Q9JL18 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bace2Q9JL18 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bace2Q9JL18 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bace2Q9JL18 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bace2Q9JL18 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bace2Q9JL18 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bace2Q9JL18 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bace2Q9JL18 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bace2Q9JL18 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bace2Q9JL18 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bace2Q9JL18 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bace2Q9JL18 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bace2Q9JL18 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Bace2Q9JL18 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Bace2Q9JL18 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Bace2Q9JL18 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Bace2Q9JL18 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Bace2Q9JL18 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Bace2Q9JL18 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Bace2Q9JL18 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bace2Q9JL18 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bace2Q9JL18 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bace2Q9JL18 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bace2Q9JL18 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bace2Q9JL18 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bace2Q9JL18 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bace2Q9JL18 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bace2Q9JL18 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Bace2Q9JL18 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bace2Q9JL18 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bace2Q9JL18 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bace2Q9JL18 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bace2Q9JL18 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bace2Q9JL18 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bace2Q9JL18 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bace2Q9JL18 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bace2Q9JL18 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bace2Q9JL18 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bace2Q9JL18 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bace2Q9JL18 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bace2Q9JL18 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bace2Q9JL18 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bace2Q9JL18 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bace2Q9JL18 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bace2Q9JL18 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bace2Q9JL18 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bace2Q9JL18 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bace2Q9JL18 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bace2Q9JL18 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bace2Q9JL18 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bace2Q9JL18 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bace2Q9JL18 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bace2Q9JL18 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bace2Q9JL18 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bace2Q9JL18 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bace2Q9JL18 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bace2Q9JL18 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bace2Q9JL18 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bace2Q9JL18 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bace2Q9JL18 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bace2Q9JL18 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bace2Q9JL18 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bace2Q9JL18 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bace2Q9JL18 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bace2Q9JL18 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bace2Q9JL18 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bace2Q9JL18 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bace2Q9JL18 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bace2Q9JL18 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bace2Q9JL18 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bace2Q9JL18 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bace2Q9JL18 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bace2Q9JL18 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bace2Q9JL18 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bace2Q9JL18 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bace2Q9JL18 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Bace2Q9JL18 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Bace2Q9JL18 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Bace2Q9JL18 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Bace2Q9JL18 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Bace2Q9JL18 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Bace2Q9JL18 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Bace2Q9JL18 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Bace2Q9JL18 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Bace2Q9JL18 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bace2Q9JL18 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bace2Q9JL18 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bace2Q9JL18 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bace2Q9JL18 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bace2Q9JL18 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Bace2Q9JL18 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bace2Q9JL18 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bace2Q9JL18 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bace2Q9JL18 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bace2Q9JL18 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bace2Q9JL18 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bace2Q9JL18 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bace2Q9JL18 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bace2Q9JL18 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bace2Q9JL18 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms