Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot9Q9JKY0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cnot9Q9JKY0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot9Q9JKY0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot9Q9JKY0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot9Q9JKY0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot9Q9JKY0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot9Q9JKY0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot9Q9JKY0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot9Q9JKY0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot9Q9JKY0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot9Q9JKY0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot9Q9JKY0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot9Q9JKY0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot9Q9JKY0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot9Q9JKY0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot9Q9JKY0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot9Q9JKY0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot9Q9JKY0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot9Q9JKY0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot9Q9JKY0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot9Q9JKY0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot9Q9JKY0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot9Q9JKY0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot9Q9JKY0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot9Q9JKY0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot9Q9JKY0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot9Q9JKY0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot9Q9JKY0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot9Q9JKY0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot9Q9JKY0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms