Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Scamp4Q9JKV5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scamp4Q9JKV5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scamp4Q9JKV5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scamp4Q9JKV5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scamp4Q9JKV5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scamp4Q9JKV5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Scamp4Q9JKV5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scamp4Q9JKV5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scamp4Q9JKV5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scamp4Q9JKV5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scamp4Q9JKV5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scamp4Q9JKV5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scamp4Q9JKV5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scamp4Q9JKV5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scamp4Q9JKV5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scamp4Q9JKV5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scamp4Q9JKV5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scamp4Q9JKV5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scamp4Q9JKV5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scamp4Q9JKV5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scamp4Q9JKV5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scamp4Q9JKV5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Scamp4Q9JKV5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scamp4Q9JKV5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scamp4Q9JKV5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scamp4Q9JKV5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scamp4Q9JKV5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scamp4Q9JKV5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scamp4Q9JKV5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scamp4Q9JKV5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scamp4Q9JKV5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scamp4Q9JKV5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scamp4Q9JKV5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scamp4Q9JKV5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scamp4Q9JKV5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scamp4Q9JKV5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scamp4Q9JKV5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scamp4Q9JKV5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Scamp4Q9JKV5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scamp4Q9JKV5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scamp4Q9JKV5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scamp4Q9JKV5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scamp4Q9JKV5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Scamp4Q9JKV5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scamp4Q9JKV5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scamp4Q9JKV5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scamp4Q9JKV5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scamp4Q9JKV5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scamp4Q9JKV5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scamp4Q9JKV5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scamp4Q9JKV5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Scamp4Q9JKV5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scamp4Q9JKV5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scamp4Q9JKV5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scamp4Q9JKV5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scamp4Q9JKV5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scamp4Q9JKV5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scamp4Q9JKV5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scamp4Q9JKV5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scamp4Q9JKV5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scamp4Q9JKV5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Scamp4Q9JKV5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Scamp4Q9JKV5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Scamp4Q9JKV5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Scamp4Q9JKV5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Scamp4Q9JKV5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Scamp4Q9JKV5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Scamp4Q9JKV5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Scamp4Q9JKV5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Scamp4Q9JKV5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Scamp4Q9JKV5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Scamp4Q9JKV5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Scamp4Q9JKV5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Scamp4Q9JKV5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Scamp4Q9JKV5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Scamp4Q9JKV5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Scamp4Q9JKV5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Scamp4Q9JKV5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Scamp4Q9JKV5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Scamp4Q9JKV5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Scamp4Q9JKV5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Scamp4Q9JKV5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Scamp4Q9JKV5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Scamp4Q9JKV5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Scamp4Q9JKV5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Scamp4Q9JKV5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Scamp4Q9JKV5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Scamp4Q9JKV5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Scamp4Q9JKV5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Scamp4Q9JKV5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Scamp4Q9JKV5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Scamp4Q9JKV5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Scamp4Q9JKV5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Scamp4Q9JKV5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Scamp4Q9JKV5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Scamp4Q9JKV5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Scamp4Q9JKV5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Scamp4Q9JKV5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Scamp4Q9JKV5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms