Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chrac1Q9JKP8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chrac1Q9JKP8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chrac1Q9JKP8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chrac1Q9JKP8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chrac1Q9JKP8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chrac1Q9JKP8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chrac1Q9JKP8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chrac1Q9JKP8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chrac1Q9JKP8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chrac1Q9JKP8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chrac1Q9JKP8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Chrac1Q9JKP8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Chrac1Q9JKP8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Chrac1Q9JKP8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Chrac1Q9JKP8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Chrac1Q9JKP8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Chrac1Q9JKP8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Chrac1Q9JKP8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Chrac1Q9JKP8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Chrac1Q9JKP8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Chrac1Q9JKP8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Chrac1Q9JKP8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Chrac1Q9JKP8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Chrac1Q9JKP8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Chrac1Q9JKP8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Chrac1Q9JKP8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Chrac1Q9JKP8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Chrac1Q9JKP8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Chrac1Q9JKP8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Chrac1Q9JKP8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Chrac1Q9JKP8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Chrac1Q9JKP8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Chrac1Q9JKP8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Chrac1Q9JKP8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Chrac1Q9JKP8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Chrac1Q9JKP8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Chrac1Q9JKP8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Chrac1Q9JKP8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Chrac1Q9JKP8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Chrac1Q9JKP8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Chrac1Q9JKP8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Chrac1Q9JKP8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Chrac1Q9JKP8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Chrac1Q9JKP8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Chrac1Q9JKP8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Chrac1Q9JKP8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Chrac1Q9JKP8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Chrac1Q9JKP8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Chrac1Q9JKP8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Chrac1Q9JKP8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Chrac1Q9JKP8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Chrac1Q9JKP8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Chrac1Q9JKP8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Chrac1Q9JKP8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Chrac1Q9JKP8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Chrac1Q9JKP8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Chrac1Q9JKP8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Chrac1Q9JKP8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Chrac1Q9JKP8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Chrac1Q9JKP8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Chrac1Q9JKP8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Chrac1Q9JKP8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Chrac1Q9JKP8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Chrac1Q9JKP8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Chrac1Q9JKP8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Chrac1Q9JKP8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Chrac1Q9JKP8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Chrac1Q9JKP8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Chrac1Q9JKP8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Chrac1Q9JKP8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Chrac1Q9JKP8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Chrac1Q9JKP8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Chrac1Q9JKP8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Chrac1Q9JKP8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Chrac1Q9JKP8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Chrac1Q9JKP8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Chrac1Q9JKP8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Chrac1Q9JKP8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Chrac1Q9JKP8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Chrac1Q9JKP8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Chrac1Q9JKP8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Chrac1Q9JKP8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Chrac1Q9JKP8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Chrac1Q9JKP8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Chrac1Q9JKP8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Chrac1Q9JKP8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Chrac1Q9JKP8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Chrac1Q9JKP8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Chrac1Q9JKP8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Chrac1Q9JKP8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Chrac1Q9JKP8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Chrac1Q9JKP8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Chrac1Q9JKP8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Chrac1Q9JKP8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Chrac1Q9JKP8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Chrac1Q9JKP8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Chrac1Q9JKP8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Chrac1Q9JKP8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Chrac1Q9JKP8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms