Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK0

Rcan3, Calcipressin-3, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcan3Q9JKK0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rcan3Q9JKK0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rcan3Q9JKK0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rcan3Q9JKK0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rcan3Q9JKK0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rcan3Q9JKK0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rcan3Q9JKK0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rcan3Q9JKK0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rcan3Q9JKK0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rcan3Q9JKK0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rcan3Q9JKK0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rcan3Q9JKK0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rcan3Q9JKK0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rcan3Q9JKK0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rcan3Q9JKK0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rcan3Q9JKK0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rcan3Q9JKK0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rcan3Q9JKK0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rcan3Q9JKK0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rcan3Q9JKK0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rcan3Q9JKK0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rcan3Q9JKK0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rcan3Q9JKK0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rcan3Q9JKK0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rcan3Q9JKK0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rcan3Q9JKK0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rcan3Q9JKK0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rcan3Q9JKK0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rcan3Q9JKK0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rcan3Q9JKK0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rcan3Q9JKK0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rcan3Q9JKK0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rcan3Q9JKK0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rcan3Q9JKK0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rcan3Q9JKK0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rcan3Q9JKK0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rcan3Q9JKK0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rcan3Q9JKK0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rcan3Q9JKK0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rcan3Q9JKK0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rcan3Q9JKK0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rcan3Q9JKK0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rcan3Q9JKK0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rcan3Q9JKK0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rcan3Q9JKK0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rcan3Q9JKK0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rcan3Q9JKK0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rcan3Q9JKK0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rcan3Q9JKK0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rcan3Q9JKK0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rcan3Q9JKK0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rcan3Q9JKK0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rcan3Q9JKK0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rcan3Q9JKK0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rcan3Q9JKK0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rcan3Q9JKK0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rcan3Q9JKK0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rcan3Q9JKK0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rcan3Q9JKK0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rcan3Q9JKK0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rcan3Q9JKK0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rcan3Q9JKK0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rcan3Q9JKK0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rcan3Q9JKK0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rcan3Q9JKK0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rcan3Q9JKK0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rcan3Q9JKK0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rcan3Q9JKK0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rcan3Q9JKK0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rcan3Q9JKK0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rcan3Q9JKK0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rcan3Q9JKK0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rcan3Q9JKK0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rcan3Q9JKK0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rcan3Q9JKK0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rcan3Q9JKK0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rcan3Q9JKK0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rcan3Q9JKK0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rcan3Q9JKK0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rcan3Q9JKK0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rcan3Q9JKK0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rcan3Q9JKK0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rcan3Q9JKK0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rcan3Q9JKK0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rcan3Q9JKK0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rcan3Q9JKK0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rcan3Q9JKK0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rcan3Q9JKK0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rcan3Q9JKK0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rcan3Q9JKK0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rcan3Q9JKK0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rcan3Q9JKK0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rcan3Q9JKK0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rcan3Q9JKK0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rcan3Q9JKK0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rcan3Q9JKK0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rcan3Q9JKK0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rcan3Q9JKK0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rcan3Q9JKK0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rcan3Q9JKK0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms