Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cyp39a1Q9JKJ9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cyp39a1Q9JKJ9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cyp39a1Q9JKJ9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cyp39a1Q9JKJ9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyp39a1Q9JKJ9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyp39a1Q9JKJ9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyp39a1Q9JKJ9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyp39a1Q9JKJ9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyp39a1Q9JKJ9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyp39a1Q9JKJ9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyp39a1Q9JKJ9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyp39a1Q9JKJ9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp39a1Q9JKJ9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp39a1Q9JKJ9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp39a1Q9JKJ9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp39a1Q9JKJ9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp39a1Q9JKJ9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp39a1Q9JKJ9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp39a1Q9JKJ9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp39a1Q9JKJ9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp39a1Q9JKJ9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp39a1Q9JKJ9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp39a1Q9JKJ9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp39a1Q9JKJ9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyp39a1Q9JKJ9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyp39a1Q9JKJ9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyp39a1Q9JKJ9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyp39a1Q9JKJ9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyp39a1Q9JKJ9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyp39a1Q9JKJ9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyp39a1Q9JKJ9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyp39a1Q9JKJ9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyp39a1Q9JKJ9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyp39a1Q9JKJ9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyp39a1Q9JKJ9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyp39a1Q9JKJ9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyp39a1Q9JKJ9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.9 ms