Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE1

Trem3, TREM-3, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem3Q9JKE1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trem3Q9JKE1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trem3Q9JKE1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trem3Q9JKE1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trem3Q9JKE1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trem3Q9JKE1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trem3Q9JKE1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trem3Q9JKE1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trem3Q9JKE1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trem3Q9JKE1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trem3Q9JKE1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trem3Q9JKE1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trem3Q9JKE1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trem3Q9JKE1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trem3Q9JKE1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trem3Q9JKE1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trem3Q9JKE1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trem3Q9JKE1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trem3Q9JKE1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trem3Q9JKE1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trem3Q9JKE1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trem3Q9JKE1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trem3Q9JKE1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trem3Q9JKE1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trem3Q9JKE1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trem3Q9JKE1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trem3Q9JKE1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trem3Q9JKE1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trem3Q9JKE1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trem3Q9JKE1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trem3Q9JKE1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trem3Q9JKE1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trem3Q9JKE1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trem3Q9JKE1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trem3Q9JKE1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trem3Q9JKE1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trem3Q9JKE1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trem3Q9JKE1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trem3Q9JKE1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trem3Q9JKE1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trem3Q9JKE1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trem3Q9JKE1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trem3Q9JKE1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trem3Q9JKE1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trem3Q9JKE1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trem3Q9JKE1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trem3Q9JKE1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trem3Q9JKE1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trem3Q9JKE1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trem3Q9JKE1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trem3Q9JKE1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trem3Q9JKE1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trem3Q9JKE1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trem3Q9JKE1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trem3Q9JKE1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trem3Q9JKE1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trem3Q9JKE1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trem3Q9JKE1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trem3Q9JKE1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trem3Q9JKE1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trem3Q9JKE1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trem3Q9JKE1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trem3Q9JKE1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trem3Q9JKE1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trem3Q9JKE1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trem3Q9JKE1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trem3Q9JKE1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trem3Q9JKE1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trem3Q9JKE1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trem3Q9JKE1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trem3Q9JKE1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trem3Q9JKE1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trem3Q9JKE1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trem3Q9JKE1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trem3Q9JKE1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trem3Q9JKE1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trem3Q9JKE1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trem3Q9JKE1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trem3Q9JKE1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trem3Q9JKE1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trem3Q9JKE1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trem3Q9JKE1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trem3Q9JKE1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trem3Q9JKE1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trem3Q9JKE1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trem3Q9JKE1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trem3Q9JKE1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trem3Q9JKE1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trem3Q9JKE1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trem3Q9JKE1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trem3Q9JKE1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trem3Q9JKE1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trem3Q9JKE1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trem3Q9JKE1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trem3Q9JKE1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trem3Q9JKE1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trem3Q9JKE1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trem3Q9JKE1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trem3Q9JKE1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trem3Q9JKE1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms