Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC7

Ap4m1, AP-4 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4m1Q9JKC7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap4m1Q9JKC7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap4m1Q9JKC7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap4m1Q9JKC7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap4m1Q9JKC7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap4m1Q9JKC7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ap4m1Q9JKC7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ap4m1Q9JKC7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ap4m1Q9JKC7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ap4m1Q9JKC7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ap4m1Q9JKC7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ap4m1Q9JKC7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ap4m1Q9JKC7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ap4m1Q9JKC7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ap4m1Q9JKC7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ap4m1Q9JKC7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ap4m1Q9JKC7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ap4m1Q9JKC7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ap4m1Q9JKC7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ap4m1Q9JKC7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ap4m1Q9JKC7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ap4m1Q9JKC7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ap4m1Q9JKC7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ap4m1Q9JKC7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ap4m1Q9JKC7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ap4m1Q9JKC7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ap4m1Q9JKC7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ap4m1Q9JKC7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ap4m1Q9JKC7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ap4m1Q9JKC7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ap4m1Q9JKC7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ap4m1Q9JKC7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ap4m1Q9JKC7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ap4m1Q9JKC7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ap4m1Q9JKC7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ap4m1Q9JKC7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ap4m1Q9JKC7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ap4m1Q9JKC7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ap4m1Q9JKC7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ap4m1Q9JKC7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ap4m1Q9JKC7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ap4m1Q9JKC7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ap4m1Q9JKC7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ap4m1Q9JKC7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ap4m1Q9JKC7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ap4m1Q9JKC7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ap4m1Q9JKC7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ap4m1Q9JKC7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ap4m1Q9JKC7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ap4m1Q9JKC7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ap4m1Q9JKC7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ap4m1Q9JKC7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ap4m1Q9JKC7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ap4m1Q9JKC7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ap4m1Q9JKC7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ap4m1Q9JKC7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ap4m1Q9JKC7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ap4m1Q9JKC7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ap4m1Q9JKC7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ap4m1Q9JKC7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ap4m1Q9JKC7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ap4m1Q9JKC7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ap4m1Q9JKC7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ap4m1Q9JKC7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ap4m1Q9JKC7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ap4m1Q9JKC7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ap4m1Q9JKC7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ap4m1Q9JKC7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ap4m1Q9JKC7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ap4m1Q9JKC7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ap4m1Q9JKC7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ap4m1Q9JKC7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ap4m1Q9JKC7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ap4m1Q9JKC7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ap4m1Q9JKC7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap4m1Q9JKC7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap4m1Q9JKC7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap4m1Q9JKC7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap4m1Q9JKC7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap4m1Q9JKC7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap4m1Q9JKC7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap4m1Q9JKC7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap4m1Q9JKC7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap4m1Q9JKC7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap4m1Q9JKC7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap4m1Q9JKC7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap4m1Q9JKC7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap4m1Q9JKC7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap4m1Q9JKC7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap4m1Q9JKC7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap4m1Q9JKC7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap4m1Q9JKC7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap4m1Q9JKC7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap4m1Q9JKC7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap4m1Q9JKC7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap4m1Q9JKC7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap4m1Q9JKC7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap4m1Q9JKC7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap4m1Q9JKC7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap4m1Q9JKC7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms