Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Msgn1Q9JK54 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Msgn1Q9JK54 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Msgn1Q9JK54 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Msgn1Q9JK54 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Msgn1Q9JK54 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Msgn1Q9JK54 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Msgn1Q9JK54 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Msgn1Q9JK54 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Msgn1Q9JK54 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Msgn1Q9JK54 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Msgn1Q9JK54 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Msgn1Q9JK54 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Msgn1Q9JK54 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Msgn1Q9JK54 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Msgn1Q9JK54 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Msgn1Q9JK54 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Msgn1Q9JK54 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Msgn1Q9JK54 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Msgn1Q9JK54 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Msgn1Q9JK54 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Msgn1Q9JK54 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Msgn1Q9JK54 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Msgn1Q9JK54 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Msgn1Q9JK54 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Msgn1Q9JK54 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Msgn1Q9JK54 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Msgn1Q9JK54 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Msgn1Q9JK54 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Msgn1Q9JK54 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Msgn1Q9JK54 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Msgn1Q9JK54 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Msgn1Q9JK54 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Msgn1Q9JK54 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Msgn1Q9JK54 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Msgn1Q9JK54 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Msgn1Q9JK54 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Msgn1Q9JK54 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Msgn1Q9JK54 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Msgn1Q9JK54 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Msgn1Q9JK54 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Msgn1Q9JK54 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Msgn1Q9JK54 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Msgn1Q9JK54 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msgn1Q9JK54 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msgn1Q9JK54 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msgn1Q9JK54 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msgn1Q9JK54 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msgn1Q9JK54 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msgn1Q9JK54 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msgn1Q9JK54 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msgn1Q9JK54 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msgn1Q9JK54 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Msgn1Q9JK54 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Msgn1Q9JK54 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Msgn1Q9JK54 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Msgn1Q9JK54 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Msgn1Q9JK54 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Msgn1Q9JK54 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Msgn1Q9JK54 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Msgn1Q9JK54 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Msgn1Q9JK54 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Msgn1Q9JK54 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Msgn1Q9JK54 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Msgn1Q9JK54 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Msgn1Q9JK54 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Msgn1Q9JK54 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Msgn1Q9JK54 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Msgn1Q9JK54 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Msgn1Q9JK54 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Msgn1Q9JK54 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Msgn1Q9JK54 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Msgn1Q9JK54 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Msgn1Q9JK54 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Msgn1Q9JK54 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Msgn1Q9JK54 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Msgn1Q9JK54 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Msgn1Q9JK54 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Msgn1Q9JK54 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Msgn1Q9JK54 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Msgn1Q9JK54 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Msgn1Q9JK54 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Msgn1Q9JK54 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Msgn1Q9JK54 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Msgn1Q9JK54 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Msgn1Q9JK54 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Msgn1Q9JK54 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Msgn1Q9JK54 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Msgn1Q9JK54 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Msgn1Q9JK54 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Msgn1Q9JK54 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Msgn1Q9JK54 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Msgn1Q9JK54 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Msgn1Q9JK54 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Msgn1Q9JK54 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Msgn1Q9JK54 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Msgn1Q9JK54 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Msgn1Q9JK54 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Msgn1Q9JK54 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Msgn1Q9JK54 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms