Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK42

Pdk2, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdk2Q9JK42 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdk2Q9JK42 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdk2Q9JK42 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdk2Q9JK42 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdk2Q9JK42 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdk2Q9JK42 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdk2Q9JK42 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdk2Q9JK42 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdk2Q9JK42 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdk2Q9JK42 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdk2Q9JK42 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdk2Q9JK42 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdk2Q9JK42 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdk2Q9JK42 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdk2Q9JK42 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdk2Q9JK42 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdk2Q9JK42 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdk2Q9JK42 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdk2Q9JK42 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdk2Q9JK42 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdk2Q9JK42 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdk2Q9JK42 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pdk2Q9JK42 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pdk2Q9JK42 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pdk2Q9JK42 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pdk2Q9JK42 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pdk2Q9JK42 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdk2Q9JK42 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdk2Q9JK42 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdk2Q9JK42 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdk2Q9JK42 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdk2Q9JK42 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdk2Q9JK42 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdk2Q9JK42 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdk2Q9JK42 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdk2Q9JK42 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdk2Q9JK42 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdk2Q9JK42 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdk2Q9JK42 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdk2Q9JK42 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdk2Q9JK42 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdk2Q9JK42 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdk2Q9JK42 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdk2Q9JK42 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdk2Q9JK42 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdk2Q9JK42 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdk2Q9JK42 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdk2Q9JK42 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdk2Q9JK42 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdk2Q9JK42 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdk2Q9JK42 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdk2Q9JK42 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdk2Q9JK42 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdk2Q9JK42 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdk2Q9JK42 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdk2Q9JK42 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdk2Q9JK42 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdk2Q9JK42 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdk2Q9JK42 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdk2Q9JK42 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdk2Q9JK42 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdk2Q9JK42 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdk2Q9JK42 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdk2Q9JK42 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdk2Q9JK42 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdk2Q9JK42 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdk2Q9JK42 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdk2Q9JK42 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdk2Q9JK42 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdk2Q9JK42 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdk2Q9JK42 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdk2Q9JK42 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdk2Q9JK42 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdk2Q9JK42 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdk2Q9JK42 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdk2Q9JK42 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdk2Q9JK42 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdk2Q9JK42 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdk2Q9JK42 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdk2Q9JK42 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdk2Q9JK42 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdk2Q9JK42 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdk2Q9JK42 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdk2Q9JK42 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdk2Q9JK42 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdk2Q9JK42 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdk2Q9JK42 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdk2Q9JK42 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdk2Q9JK42 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdk2Q9JK42 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdk2Q9JK42 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdk2Q9JK42 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdk2Q9JK42 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Pdk2Q9JK42 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdk2Q9JK42 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Pdk2Q9JK42 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Pdk2Q9JK42 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Pdk2Q9JK42 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdk2Q9JK42 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdk2Q9JK42 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms