Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Efcc1Q9JJF6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Efcc1Q9JJF6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Efcc1Q9JJF6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Efcc1Q9JJF6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Efcc1Q9JJF6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Efcc1Q9JJF6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Efcc1Q9JJF6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Efcc1Q9JJF6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Efcc1Q9JJF6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Efcc1Q9JJF6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Efcc1Q9JJF6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Efcc1Q9JJF6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Efcc1Q9JJF6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Efcc1Q9JJF6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Efcc1Q9JJF6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Efcc1Q9JJF6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Efcc1Q9JJF6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Efcc1Q9JJF6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Efcc1Q9JJF6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Efcc1Q9JJF6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Efcc1Q9JJF6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Efcc1Q9JJF6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Efcc1Q9JJF6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Efcc1Q9JJF6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Efcc1Q9JJF6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Efcc1Q9JJF6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Efcc1Q9JJF6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Efcc1Q9JJF6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Efcc1Q9JJF6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Efcc1Q9JJF6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Efcc1Q9JJF6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Efcc1Q9JJF6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Efcc1Q9JJF6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Efcc1Q9JJF6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Efcc1Q9JJF6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Efcc1Q9JJF6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Efcc1Q9JJF6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Efcc1Q9JJF6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Efcc1Q9JJF6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Efcc1Q9JJF6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Efcc1Q9JJF6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Efcc1Q9JJF6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Efcc1Q9JJF6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Efcc1Q9JJF6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Efcc1Q9JJF6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Efcc1Q9JJF6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Efcc1Q9JJF6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Efcc1Q9JJF6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Efcc1Q9JJF6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Efcc1Q9JJF6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Efcc1Q9JJF6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Efcc1Q9JJF6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Efcc1Q9JJF6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Efcc1Q9JJF6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Efcc1Q9JJF6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Efcc1Q9JJF6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Efcc1Q9JJF6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Efcc1Q9JJF6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Efcc1Q9JJF6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Efcc1Q9JJF6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Efcc1Q9JJF6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Efcc1Q9JJF6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Efcc1Q9JJF6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Efcc1Q9JJF6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Efcc1Q9JJF6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Efcc1Q9JJF6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Efcc1Q9JJF6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Efcc1Q9JJF6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Efcc1Q9JJF6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Efcc1Q9JJF6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Efcc1Q9JJF6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Efcc1Q9JJF6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Efcc1Q9JJF6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Efcc1Q9JJF6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Efcc1Q9JJF6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Efcc1Q9JJF6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Efcc1Q9JJF6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Efcc1Q9JJF6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Efcc1Q9JJF6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Efcc1Q9JJF6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Efcc1Q9JJF6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Efcc1Q9JJF6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Efcc1Q9JJF6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Efcc1Q9JJF6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Efcc1Q9JJF6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Efcc1Q9JJF6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Efcc1Q9JJF6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Efcc1Q9JJF6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Efcc1Q9JJF6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Efcc1Q9JJF6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Efcc1Q9JJF6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Efcc1Q9JJF6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Efcc1Q9JJF6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Efcc1Q9JJF6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Efcc1Q9JJF6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Efcc1Q9JJF6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Efcc1Q9JJF6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Efcc1Q9JJF6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Efcc1Q9JJF6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms