Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpf2Q9JJ80 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpf2Q9JJ80 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpf2Q9JJ80 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpf2Q9JJ80 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpf2Q9JJ80 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpf2Q9JJ80 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpf2Q9JJ80 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpf2Q9JJ80 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpf2Q9JJ80 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpf2Q9JJ80 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpf2Q9JJ80 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpf2Q9JJ80 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpf2Q9JJ80 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpf2Q9JJ80 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpf2Q9JJ80 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpf2Q9JJ80 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpf2Q9JJ80 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpf2Q9JJ80 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpf2Q9JJ80 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpf2Q9JJ80 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpf2Q9JJ80 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpf2Q9JJ80 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpf2Q9JJ80 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpf2Q9JJ80 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpf2Q9JJ80 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpf2Q9JJ80 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpf2Q9JJ80 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpf2Q9JJ80 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpf2Q9JJ80 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpf2Q9JJ80 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpf2Q9JJ80 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpf2Q9JJ80 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpf2Q9JJ80 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpf2Q9JJ80 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpf2Q9JJ80 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpf2Q9JJ80 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpf2Q9JJ80 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpf2Q9JJ80 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpf2Q9JJ80 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpf2Q9JJ80 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpf2Q9JJ80 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpf2Q9JJ80 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpf2Q9JJ80 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpf2Q9JJ80 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpf2Q9JJ80 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpf2Q9JJ80 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpf2Q9JJ80 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpf2Q9JJ80 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpf2Q9JJ80 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpf2Q9JJ80 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpf2Q9JJ80 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpf2Q9JJ80 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpf2Q9JJ80 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpf2Q9JJ80 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpf2Q9JJ80 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpf2Q9JJ80 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpf2Q9JJ80 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpf2Q9JJ80 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpf2Q9JJ80 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpf2Q9JJ80 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rpf2Q9JJ80 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rpf2Q9JJ80 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rpf2Q9JJ80 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rpf2Q9JJ80 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rpf2Q9JJ80 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rpf2Q9JJ80 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rpf2Q9JJ80 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rpf2Q9JJ80 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rpf2Q9JJ80 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpf2Q9JJ80 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpf2Q9JJ80 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpf2Q9JJ80 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpf2Q9JJ80 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpf2Q9JJ80 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpf2Q9JJ80 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpf2Q9JJ80 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpf2Q9JJ80 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpf2Q9JJ80 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpf2Q9JJ80 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpf2Q9JJ80 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpf2Q9JJ80 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpf2Q9JJ80 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpf2Q9JJ80 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpf2Q9JJ80 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpf2Q9JJ80 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpf2Q9JJ80 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpf2Q9JJ80 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpf2Q9JJ80 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpf2Q9JJ80 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpf2Q9JJ80 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpf2Q9JJ80 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpf2Q9JJ80 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpf2Q9JJ80 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpf2Q9JJ80 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpf2Q9JJ80 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpf2Q9JJ80 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpf2Q9JJ80 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpf2Q9JJ80 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpf2Q9JJ80 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms