Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ72

Rprm, Protein reprimo, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RprmQ9JJ72 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RprmQ9JJ72 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RprmQ9JJ72 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RprmQ9JJ72 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RprmQ9JJ72 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RprmQ9JJ72 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RprmQ9JJ72 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RprmQ9JJ72 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RprmQ9JJ72 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RprmQ9JJ72 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RprmQ9JJ72 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RprmQ9JJ72 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RprmQ9JJ72 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RprmQ9JJ72 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RprmQ9JJ72 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RprmQ9JJ72 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RprmQ9JJ72 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RprmQ9JJ72 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RprmQ9JJ72 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RprmQ9JJ72 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RprmQ9JJ72 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RprmQ9JJ72 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RprmQ9JJ72 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RprmQ9JJ72 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RprmQ9JJ72 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RprmQ9JJ72 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RprmQ9JJ72 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RprmQ9JJ72 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RprmQ9JJ72 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RprmQ9JJ72 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RprmQ9JJ72 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RprmQ9JJ72 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RprmQ9JJ72 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RprmQ9JJ72 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RprmQ9JJ72 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RprmQ9JJ72 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RprmQ9JJ72 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RprmQ9JJ72 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RprmQ9JJ72 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RprmQ9JJ72 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RprmQ9JJ72 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RprmQ9JJ72 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RprmQ9JJ72 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RprmQ9JJ72 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RprmQ9JJ72 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RprmQ9JJ72 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RprmQ9JJ72 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RprmQ9JJ72 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RprmQ9JJ72 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RprmQ9JJ72 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RprmQ9JJ72 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RprmQ9JJ72 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RprmQ9JJ72 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RprmQ9JJ72 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RprmQ9JJ72 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms