Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ57

Kcnip1, Kv channel-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip1Q9JJ57 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnip1Q9JJ57 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnip1Q9JJ57 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnip1Q9JJ57 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnip1Q9JJ57 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnip1Q9JJ57 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnip1Q9JJ57 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnip1Q9JJ57 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnip1Q9JJ57 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnip1Q9JJ57 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnip1Q9JJ57 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnip1Q9JJ57 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnip1Q9JJ57 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnip1Q9JJ57 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnip1Q9JJ57 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnip1Q9JJ57 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnip1Q9JJ57 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnip1Q9JJ57 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnip1Q9JJ57 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnip1Q9JJ57 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnip1Q9JJ57 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnip1Q9JJ57 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnip1Q9JJ57 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnip1Q9JJ57 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnip1Q9JJ57 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnip1Q9JJ57 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnip1Q9JJ57 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnip1Q9JJ57 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnip1Q9JJ57 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnip1Q9JJ57 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnip1Q9JJ57 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnip1Q9JJ57 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnip1Q9JJ57 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnip1Q9JJ57 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnip1Q9JJ57 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnip1Q9JJ57 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnip1Q9JJ57 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnip1Q9JJ57 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnip1Q9JJ57 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnip1Q9JJ57 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnip1Q9JJ57 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnip1Q9JJ57 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnip1Q9JJ57 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnip1Q9JJ57 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnip1Q9JJ57 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnip1Q9JJ57 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Kcnip1Q9JJ57 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnip1Q9JJ57 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnip1Q9JJ57 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnip1Q9JJ57 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnip1Q9JJ57 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnip1Q9JJ57 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnip1Q9JJ57 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnip1Q9JJ57 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnip1Q9JJ57 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnip1Q9JJ57 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnip1Q9JJ57 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnip1Q9JJ57 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnip1Q9JJ57 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnip1Q9JJ57 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnip1Q9JJ57 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnip1Q9JJ57 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnip1Q9JJ57 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnip1Q9JJ57 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnip1Q9JJ57 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnip1Q9JJ57 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnip1Q9JJ57 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnip1Q9JJ57 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnip1Q9JJ57 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnip1Q9JJ57 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnip1Q9JJ57 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnip1Q9JJ57 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnip1Q9JJ57 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnip1Q9JJ57 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnip1Q9JJ57 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnip1Q9JJ57 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnip1Q9JJ57 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnip1Q9JJ57 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnip1Q9JJ57 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnip1Q9JJ57 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnip1Q9JJ57 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnip1Q9JJ57 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnip1Q9JJ57 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnip1Q9JJ57 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnip1Q9JJ57 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnip1Q9JJ57 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnip1Q9JJ57 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnip1Q9JJ57 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnip1Q9JJ57 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnip1Q9JJ57 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnip1Q9JJ57 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnip1Q9JJ57 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnip1Q9JJ57 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnip1Q9JJ57 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnip1Q9JJ57 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnip1Q9JJ57 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnip1Q9JJ57 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnip1Q9JJ57 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnip1Q9JJ57 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnip1Q9JJ57 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms