Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacna1fQ9JIS7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacna1fQ9JIS7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacna1fQ9JIS7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacna1fQ9JIS7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacna1fQ9JIS7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacna1fQ9JIS7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacna1fQ9JIS7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacna1fQ9JIS7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacna1fQ9JIS7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacna1fQ9JIS7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacna1fQ9JIS7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacna1fQ9JIS7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cacna1fQ9JIS7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cacna1fQ9JIS7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cacna1fQ9JIS7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cacna1fQ9JIS7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cacna1fQ9JIS7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cacna1fQ9JIS7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cacna1fQ9JIS7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cacna1fQ9JIS7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cacna1fQ9JIS7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cacna1fQ9JIS7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cacna1fQ9JIS7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cacna1fQ9JIS7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cacna1fQ9JIS7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cacna1fQ9JIS7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacna1fQ9JIS7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacna1fQ9JIS7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacna1fQ9JIS7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacna1fQ9JIS7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacna1fQ9JIS7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacna1fQ9JIS7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacna1fQ9JIS7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cacna1fQ9JIS7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cacna1fQ9JIS7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cacna1fQ9JIS7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cacna1fQ9JIS7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cacna1fQ9JIS7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cacna1fQ9JIS7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cacna1fQ9JIS7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cacna1fQ9JIS7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cacna1fQ9JIS7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cacna1fQ9JIS7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cacna1fQ9JIS7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cacna1fQ9JIS7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cacna1fQ9JIS7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cacna1fQ9JIS7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cacna1fQ9JIS7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cacna1fQ9JIS7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Cacna1fQ9JIS7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cacna1fQ9JIS7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cacna1fQ9JIS7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cacna1fQ9JIS7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cacna1fQ9JIS7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cacna1fQ9JIS7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cacna1fQ9JIS7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cacna1fQ9JIS7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cacna1fQ9JIS7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cacna1fQ9JIS7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cacna1fQ9JIS7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cacna1fQ9JIS7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cacna1fQ9JIS7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cacna1fQ9JIS7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cacna1fQ9JIS7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cacna1fQ9JIS7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cacna1fQ9JIS7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacna1fQ9JIS7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacna1fQ9JIS7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacna1fQ9JIS7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacna1fQ9JIS7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacna1fQ9JIS7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cacna1fQ9JIS7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cacna1fQ9JIS7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cacna1fQ9JIS7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cacna1fQ9JIS7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cacna1fQ9JIS7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cacna1fQ9JIS7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cacna1fQ9JIS7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cacna1fQ9JIS7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cacna1fQ9JIS7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacna1fQ9JIS7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacna1fQ9JIS7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacna1fQ9JIS7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacna1fQ9JIS7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacna1fQ9JIS7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacna1fQ9JIS7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacna1fQ9JIS7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacna1fQ9JIS7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacna1fQ9JIS7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacna1fQ9JIS7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacna1fQ9JIS7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacna1fQ9JIS7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacna1fQ9JIS7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacna1fQ9JIS7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacna1fQ9JIS7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacna1fQ9JIS7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacna1fQ9JIS7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cacna1fQ9JIS7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cacna1fQ9JIS7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms