Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcirg1Q9JHF5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcirg1Q9JHF5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcirg1Q9JHF5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcirg1Q9JHF5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcirg1Q9JHF5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcirg1Q9JHF5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcirg1Q9JHF5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcirg1Q9JHF5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcirg1Q9JHF5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcirg1Q9JHF5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcirg1Q9JHF5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcirg1Q9JHF5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcirg1Q9JHF5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcirg1Q9JHF5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcirg1Q9JHF5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcirg1Q9JHF5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tcirg1Q9JHF5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tcirg1Q9JHF5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tcirg1Q9JHF5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Tcirg1Q9JHF5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tcirg1Q9JHF5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcirg1Q9JHF5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcirg1Q9JHF5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcirg1Q9JHF5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcirg1Q9JHF5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcirg1Q9JHF5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcirg1Q9JHF5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcirg1Q9JHF5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcirg1Q9JHF5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcirg1Q9JHF5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcirg1Q9JHF5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcirg1Q9JHF5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcirg1Q9JHF5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcirg1Q9JHF5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcirg1Q9JHF5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcirg1Q9JHF5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcirg1Q9JHF5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcirg1Q9JHF5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcirg1Q9JHF5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcirg1Q9JHF5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcirg1Q9JHF5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcirg1Q9JHF5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcirg1Q9JHF5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcirg1Q9JHF5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcirg1Q9JHF5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcirg1Q9JHF5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcirg1Q9JHF5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcirg1Q9JHF5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcirg1Q9JHF5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcirg1Q9JHF5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcirg1Q9JHF5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcirg1Q9JHF5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcirg1Q9JHF5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcirg1Q9JHF5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcirg1Q9JHF5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcirg1Q9JHF5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcirg1Q9JHF5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcirg1Q9JHF5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcirg1Q9JHF5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcirg1Q9JHF5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcirg1Q9JHF5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcirg1Q9JHF5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcirg1Q9JHF5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcirg1Q9JHF5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcirg1Q9JHF5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcirg1Q9JHF5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcirg1Q9JHF5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcirg1Q9JHF5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcirg1Q9JHF5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcirg1Q9JHF5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcirg1Q9JHF5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcirg1Q9JHF5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcirg1Q9JHF5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcirg1Q9JHF5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcirg1Q9JHF5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcirg1Q9JHF5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcirg1Q9JHF5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcirg1Q9JHF5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcirg1Q9JHF5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcirg1Q9JHF5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcirg1Q9JHF5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcirg1Q9JHF5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcirg1Q9JHF5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tcirg1Q9JHF5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tcirg1Q9JHF5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tcirg1Q9JHF5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tcirg1Q9JHF5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tcirg1Q9JHF5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tcirg1Q9JHF5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tcirg1Q9JHF5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tcirg1Q9JHF5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tcirg1Q9JHF5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1
Tcirg1Q9JHF5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tcirg1Q9JHF5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tcirg1Q9JHF5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tcirg1Q9JHF5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tcirg1Q9JHF5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Tcirg1Q9JHF5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Tcirg1Q9JHF5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms