Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN6

Trim2, Tripartite motif-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim2Q9ESN6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim2Q9ESN6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim2Q9ESN6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim2Q9ESN6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim2Q9ESN6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim2Q9ESN6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim2Q9ESN6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim2Q9ESN6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim2Q9ESN6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim2Q9ESN6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim2Q9ESN6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim2Q9ESN6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim2Q9ESN6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim2Q9ESN6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim2Q9ESN6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim2Q9ESN6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim2Q9ESN6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim2Q9ESN6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim2Q9ESN6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim2Q9ESN6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim2Q9ESN6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim2Q9ESN6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim2Q9ESN6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim2Q9ESN6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim2Q9ESN6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim2Q9ESN6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim2Q9ESN6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim2Q9ESN6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim2Q9ESN6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim2Q9ESN6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim2Q9ESN6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim2Q9ESN6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim2Q9ESN6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim2Q9ESN6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim2Q9ESN6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim2Q9ESN6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim2Q9ESN6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim2Q9ESN6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim2Q9ESN6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim2Q9ESN6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim2Q9ESN6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim2Q9ESN6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim2Q9ESN6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim2Q9ESN6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim2Q9ESN6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim2Q9ESN6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim2Q9ESN6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim2Q9ESN6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim2Q9ESN6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim2Q9ESN6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim2Q9ESN6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim2Q9ESN6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim2Q9ESN6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim2Q9ESN6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim2Q9ESN6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim2Q9ESN6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim2Q9ESN6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim2Q9ESN6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim2Q9ESN6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim2Q9ESN6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim2Q9ESN6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim2Q9ESN6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim2Q9ESN6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim2Q9ESN6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim2Q9ESN6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim2Q9ESN6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim2Q9ESN6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim2Q9ESN6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim2Q9ESN6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim2Q9ESN6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim2Q9ESN6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim2Q9ESN6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim2Q9ESN6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim2Q9ESN6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim2Q9ESN6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim2Q9ESN6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim2Q9ESN6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim2Q9ESN6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim2Q9ESN6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim2Q9ESN6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim2Q9ESN6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim2Q9ESN6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim2Q9ESN6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim2Q9ESN6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim2Q9ESN6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim2Q9ESN6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim2Q9ESN6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim2Q9ESN6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim2Q9ESN6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim2Q9ESN6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim2Q9ESN6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim2Q9ESN6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim2Q9ESN6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim2Q9ESN6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim2Q9ESN6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim2Q9ESN6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim2Q9ESN6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim2Q9ESN6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim2Q9ESN6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim2Q9ESN6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms