Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESM3

Hapln2, Hyaluronan and proteoglycan link protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hapln2Q9ESM3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Hapln2Q9ESM3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Hapln2Q9ESM3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Hapln2Q9ESM3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Hapln2Q9ESM3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hapln2Q9ESM3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Hapln2Q9ESM3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hapln2Q9ESM3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hapln2Q9ESM3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hapln2Q9ESM3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hapln2Q9ESM3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hapln2Q9ESM3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hapln2Q9ESM3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hapln2Q9ESM3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hapln2Q9ESM3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hapln2Q9ESM3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hapln2Q9ESM3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hapln2Q9ESM3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hapln2Q9ESM3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hapln2Q9ESM3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hapln2Q9ESM3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hapln2Q9ESM3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hapln2Q9ESM3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hapln2Q9ESM3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hapln2Q9ESM3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hapln2Q9ESM3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hapln2Q9ESM3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Hapln2Q9ESM3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hapln2Q9ESM3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hapln2Q9ESM3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hapln2Q9ESM3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hapln2Q9ESM3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hapln2Q9ESM3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Hapln2Q9ESM3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hapln2Q9ESM3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hapln2Q9ESM3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hapln2Q9ESM3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hapln2Q9ESM3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hapln2Q9ESM3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hapln2Q9ESM3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hapln2Q9ESM3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Hapln2Q9ESM3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hapln2Q9ESM3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hapln2Q9ESM3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hapln2Q9ESM3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hapln2Q9ESM3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hapln2Q9ESM3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hapln2Q9ESM3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hapln2Q9ESM3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hapln2Q9ESM3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hapln2Q9ESM3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hapln2Q9ESM3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hapln2Q9ESM3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hapln2Q9ESM3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hapln2Q9ESM3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hapln2Q9ESM3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hapln2Q9ESM3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hapln2Q9ESM3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hapln2Q9ESM3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hapln2Q9ESM3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Hapln2Q9ESM3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hapln2Q9ESM3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hapln2Q9ESM3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hapln2Q9ESM3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hapln2Q9ESM3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Hapln2Q9ESM3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hapln2Q9ESM3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Hapln2Q9ESM3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hapln2Q9ESM3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hapln2Q9ESM3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hapln2Q9ESM3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hapln2Q9ESM3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hapln2Q9ESM3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hapln2Q9ESM3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hapln2Q9ESM3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hapln2Q9ESM3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hapln2Q9ESM3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hapln2Q9ESM3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hapln2Q9ESM3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hapln2Q9ESM3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Hapln2Q9ESM3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hapln2Q9ESM3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hapln2Q9ESM3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hapln2Q9ESM3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Hapln2Q9ESM3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hapln2Q9ESM3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hapln2Q9ESM3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hapln2Q9ESM3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hapln2Q9ESM3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hapln2Q9ESM3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hapln2Q9ESM3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hapln2Q9ESM3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hapln2Q9ESM3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hapln2Q9ESM3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hapln2Q9ESM3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hapln2Q9ESM3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hapln2Q9ESM3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hapln2Q9ESM3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hapln2Q9ESM3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hapln2Q9ESM3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms