Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES46

Parvb, Beta-parvin, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParvbQ9ES46 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ParvbQ9ES46 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ParvbQ9ES46 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ParvbQ9ES46 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ParvbQ9ES46 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ParvbQ9ES46 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ParvbQ9ES46 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ParvbQ9ES46 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ParvbQ9ES46 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ParvbQ9ES46 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ParvbQ9ES46 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ParvbQ9ES46 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ParvbQ9ES46 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ParvbQ9ES46 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ParvbQ9ES46 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ParvbQ9ES46 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ParvbQ9ES46 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ParvbQ9ES46 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ParvbQ9ES46 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ParvbQ9ES46 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ParvbQ9ES46 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ParvbQ9ES46 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ParvbQ9ES46 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ParvbQ9ES46 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ParvbQ9ES46 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ParvbQ9ES46 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ParvbQ9ES46 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ParvbQ9ES46 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ParvbQ9ES46 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ParvbQ9ES46 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ParvbQ9ES46 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ParvbQ9ES46 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ParvbQ9ES46 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ParvbQ9ES46 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ParvbQ9ES46 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ParvbQ9ES46 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ParvbQ9ES46 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ParvbQ9ES46 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ParvbQ9ES46 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ParvbQ9ES46 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ParvbQ9ES46 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ParvbQ9ES46 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ParvbQ9ES46 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ParvbQ9ES46 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ParvbQ9ES46 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ParvbQ9ES46 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ParvbQ9ES46 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ParvbQ9ES46 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ParvbQ9ES46 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ParvbQ9ES46 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ParvbQ9ES46 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ParvbQ9ES46 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ParvbQ9ES46 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ParvbQ9ES46 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ParvbQ9ES46 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ParvbQ9ES46 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ParvbQ9ES46 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ParvbQ9ES46 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ParvbQ9ES46 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ParvbQ9ES46 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ParvbQ9ES46 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ParvbQ9ES46 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ParvbQ9ES46 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ParvbQ9ES46 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ParvbQ9ES46 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ParvbQ9ES46 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ParvbQ9ES46 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ParvbQ9ES46 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ParvbQ9ES46 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ParvbQ9ES46 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ParvbQ9ES46 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ParvbQ9ES46 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ParvbQ9ES46 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ParvbQ9ES46 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ParvbQ9ES46 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ParvbQ9ES46 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ParvbQ9ES46 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ParvbQ9ES46 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ParvbQ9ES46 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ParvbQ9ES46 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ParvbQ9ES46 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ParvbQ9ES46 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ParvbQ9ES46 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ParvbQ9ES46 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ParvbQ9ES46 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ParvbQ9ES46 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ParvbQ9ES46 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ParvbQ9ES46 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ParvbQ9ES46 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ParvbQ9ES46 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ParvbQ9ES46 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ParvbQ9ES46 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ParvbQ9ES46 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ParvbQ9ES46 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ParvbQ9ES46 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ParvbQ9ES46 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ParvbQ9ES46 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ParvbQ9ES46 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ParvbQ9ES46 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ParvbQ9ES46 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms