Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA6

Tfip11, Tuftelin-interacting protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfip11Q9ERA6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tfip11Q9ERA6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tfip11Q9ERA6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tfip11Q9ERA6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tfip11Q9ERA6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tfip11Q9ERA6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tfip11Q9ERA6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tfip11Q9ERA6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tfip11Q9ERA6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tfip11Q9ERA6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tfip11Q9ERA6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tfip11Q9ERA6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tfip11Q9ERA6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tfip11Q9ERA6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tfip11Q9ERA6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tfip11Q9ERA6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Tfip11Q9ERA6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tfip11Q9ERA6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tfip11Q9ERA6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tfip11Q9ERA6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tfip11Q9ERA6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tfip11Q9ERA6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tfip11Q9ERA6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tfip11Q9ERA6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tfip11Q9ERA6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tfip11Q9ERA6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tfip11Q9ERA6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tfip11Q9ERA6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tfip11Q9ERA6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tfip11Q9ERA6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Tfip11Q9ERA6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tfip11Q9ERA6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tfip11Q9ERA6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tfip11Q9ERA6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tfip11Q9ERA6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Tfip11Q9ERA6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tfip11Q9ERA6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tfip11Q9ERA6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tfip11Q9ERA6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tfip11Q9ERA6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tfip11Q9ERA6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tfip11Q9ERA6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Tfip11Q9ERA6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tfip11Q9ERA6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Tfip11Q9ERA6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tfip11Q9ERA6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Tfip11Q9ERA6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tfip11Q9ERA6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tfip11Q9ERA6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tfip11Q9ERA6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tfip11Q9ERA6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tfip11Q9ERA6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tfip11Q9ERA6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tfip11Q9ERA6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tfip11Q9ERA6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tfip11Q9ERA6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tfip11Q9ERA6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tfip11Q9ERA6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tfip11Q9ERA6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tfip11Q9ERA6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tfip11Q9ERA6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tfip11Q9ERA6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tfip11Q9ERA6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tfip11Q9ERA6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tfip11Q9ERA6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tfip11Q9ERA6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tfip11Q9ERA6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tfip11Q9ERA6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tfip11Q9ERA6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tfip11Q9ERA6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tfip11Q9ERA6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tfip11Q9ERA6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tfip11Q9ERA6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tfip11Q9ERA6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tfip11Q9ERA6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tfip11Q9ERA6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tfip11Q9ERA6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Tfip11Q9ERA6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tfip11Q9ERA6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tfip11Q9ERA6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tfip11Q9ERA6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tfip11Q9ERA6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tfip11Q9ERA6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tfip11Q9ERA6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tfip11Q9ERA6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tfip11Q9ERA6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tfip11Q9ERA6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tfip11Q9ERA6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tfip11Q9ERA6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Tfip11Q9ERA6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tfip11Q9ERA6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tfip11Q9ERA6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tfip11Q9ERA6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tfip11Q9ERA6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tfip11Q9ERA6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tfip11Q9ERA6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tfip11Q9ERA6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tfip11Q9ERA6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Tfip11Q9ERA6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tfip11Q9ERA6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms