Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dap3Q9ER88 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dap3Q9ER88 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dap3Q9ER88 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Dap3Q9ER88 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dap3Q9ER88 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dap3Q9ER88 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dap3Q9ER88 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Dap3Q9ER88 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dap3Q9ER88 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dap3Q9ER88 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dap3Q9ER88 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dap3Q9ER88 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dap3Q9ER88 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dap3Q9ER88 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dap3Q9ER88 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dap3Q9ER88 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dap3Q9ER88 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dap3Q9ER88 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dap3Q9ER88 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dap3Q9ER88 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Dap3Q9ER88 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dap3Q9ER88 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dap3Q9ER88 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dap3Q9ER88 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dap3Q9ER88 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dap3Q9ER88 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dap3Q9ER88 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dap3Q9ER88 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dap3Q9ER88 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dap3Q9ER88 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dap3Q9ER88 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dap3Q9ER88 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dap3Q9ER88 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dap3Q9ER88 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dap3Q9ER88 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dap3Q9ER88 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dap3Q9ER88 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Dap3Q9ER88 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dap3Q9ER88 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dap3Q9ER88 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dap3Q9ER88 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dap3Q9ER88 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dap3Q9ER88 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dap3Q9ER88 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dap3Q9ER88 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dap3Q9ER88 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dap3Q9ER88 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Dap3Q9ER88 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dap3Q9ER88 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dap3Q9ER88 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dap3Q9ER88 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dap3Q9ER88 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dap3Q9ER88 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dap3Q9ER88 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dap3Q9ER88 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dap3Q9ER88 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dap3Q9ER88 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dap3Q9ER88 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dap3Q9ER88 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dap3Q9ER88 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dap3Q9ER88 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dap3Q9ER88 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dap3Q9ER88 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dap3Q9ER88 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dap3Q9ER88 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Dap3Q9ER88 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dap3Q9ER88 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dap3Q9ER88 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dap3Q9ER88 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dap3Q9ER88 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dap3Q9ER88 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dap3Q9ER88 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dap3Q9ER88 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dap3Q9ER88 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dap3Q9ER88 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dap3Q9ER88 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dap3Q9ER88 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dap3Q9ER88 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dap3Q9ER88 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dap3Q9ER88 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dap3Q9ER88 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dap3Q9ER88 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dap3Q9ER88 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dap3Q9ER88 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dap3Q9ER88 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dap3Q9ER88 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dap3Q9ER88 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dap3Q9ER88 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dap3Q9ER88 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dap3Q9ER88 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dap3Q9ER88 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dap3Q9ER88 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dap3Q9ER88 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dap3Q9ER88 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dap3Q9ER88 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dap3Q9ER88 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dap3Q9ER88 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dap3Q9ER88 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dap3Q9ER88 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms