Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER63

Tnfrsf23, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 23, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf23Q9ER63 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf23Q9ER63 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfrsf23Q9ER63 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf23Q9ER63 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf23Q9ER63 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf23Q9ER63 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf23Q9ER63 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf23Q9ER63 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf23Q9ER63 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf23Q9ER63 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf23Q9ER63 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf23Q9ER63 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf23Q9ER63 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf23Q9ER63 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf23Q9ER63 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf23Q9ER63 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf23Q9ER63 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf23Q9ER63 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf23Q9ER63 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf23Q9ER63 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf23Q9ER63 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf23Q9ER63 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf23Q9ER63 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf23Q9ER63 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf23Q9ER63 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf23Q9ER63 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf23Q9ER63 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf23Q9ER63 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf23Q9ER63 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf23Q9ER63 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf23Q9ER63 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf23Q9ER63 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf23Q9ER63 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf23Q9ER63 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf23Q9ER63 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf23Q9ER63 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf23Q9ER63 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf23Q9ER63 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfrsf23Q9ER63 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfrsf23Q9ER63 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf23Q9ER63 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf23Q9ER63 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf23Q9ER63 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf23Q9ER63 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf23Q9ER63 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf23Q9ER63 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf23Q9ER63 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf23Q9ER63 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf23Q9ER63 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf23Q9ER63 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf23Q9ER63 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf23Q9ER63 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf23Q9ER63 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf23Q9ER63 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf23Q9ER63 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf23Q9ER63 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf23Q9ER63 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf23Q9ER63 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf23Q9ER63 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf23Q9ER63 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf23Q9ER63 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf23Q9ER63 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf23Q9ER63 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf23Q9ER63 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf23Q9ER63 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf23Q9ER63 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf23Q9ER63 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf23Q9ER63 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf23Q9ER63 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf23Q9ER63 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf23Q9ER63 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf23Q9ER63 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf23Q9ER63 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf23Q9ER63 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf23Q9ER63 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf23Q9ER63 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf23Q9ER63 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfrsf23Q9ER63 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfrsf23Q9ER63 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfrsf23Q9ER63 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfrsf23Q9ER63 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfrsf23Q9ER63 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms