Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Capn12Q9ER56 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Capn12Q9ER56 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Capn12Q9ER56 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Capn12Q9ER56 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Capn12Q9ER56 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Capn12Q9ER56 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Capn12Q9ER56 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Capn12Q9ER56 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Capn12Q9ER56 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Capn12Q9ER56 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Capn12Q9ER56 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Capn12Q9ER56 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Capn12Q9ER56 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Capn12Q9ER56 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Capn12Q9ER56 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Capn12Q9ER56 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Capn12Q9ER56 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Capn12Q9ER56 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Capn12Q9ER56 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Capn12Q9ER56 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Capn12Q9ER56 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Capn12Q9ER56 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Capn12Q9ER56 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Capn12Q9ER56 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Capn12Q9ER56 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Capn12Q9ER56 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Capn12Q9ER56 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Capn12Q9ER56 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Capn12Q9ER56 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Capn12Q9ER56 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Capn12Q9ER56 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Capn12Q9ER56 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Capn12Q9ER56 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Capn12Q9ER56 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Capn12Q9ER56 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Capn12Q9ER56 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Capn12Q9ER56 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Capn12Q9ER56 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Capn12Q9ER56 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Capn12Q9ER56 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Capn12Q9ER56 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Capn12Q9ER56 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Capn12Q9ER56 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Capn12Q9ER56 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Capn12Q9ER56 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Capn12Q9ER56 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Capn12Q9ER56 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Capn12Q9ER56 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Capn12Q9ER56 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Capn12Q9ER56 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Capn12Q9ER56 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Capn12Q9ER56 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Capn12Q9ER56 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Capn12Q9ER56 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Capn12Q9ER56 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Capn12Q9ER56 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Capn12Q9ER56 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Capn12Q9ER56 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Capn12Q9ER56 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Capn12Q9ER56 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Capn12Q9ER56 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Capn12Q9ER56 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Capn12Q9ER56 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Capn12Q9ER56 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Capn12Q9ER56 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Capn12Q9ER56 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capn12Q9ER56 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capn12Q9ER56 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capn12Q9ER56 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capn12Q9ER56 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capn12Q9ER56 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capn12Q9ER56 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Capn12Q9ER56 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capn12Q9ER56 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capn12Q9ER56 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capn12Q9ER56 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Capn12Q9ER56 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Capn12Q9ER56 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Capn12Q9ER56 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Capn12Q9ER56 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Capn12Q9ER56 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Capn12Q9ER56 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Capn12Q9ER56 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Capn12Q9ER56 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Capn12Q9ER56 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Capn12Q9ER56 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Capn12Q9ER56 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Capn12Q9ER56 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Capn12Q9ER56 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Capn12Q9ER56 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Capn12Q9ER56 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Capn12Q9ER56 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Capn12Q9ER56 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Capn12Q9ER56 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Capn12Q9ER56 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Capn12Q9ER56 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Capn12Q9ER56 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Capn12Q9ER56 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Capn12Q9ER56 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms