Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM6

Dgcr8, Microprocessor complex subunit DGCR8, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr8Q9EQM6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dgcr8Q9EQM6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dgcr8Q9EQM6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dgcr8Q9EQM6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dgcr8Q9EQM6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dgcr8Q9EQM6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dgcr8Q9EQM6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dgcr8Q9EQM6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dgcr8Q9EQM6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dgcr8Q9EQM6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dgcr8Q9EQM6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dgcr8Q9EQM6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dgcr8Q9EQM6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dgcr8Q9EQM6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dgcr8Q9EQM6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dgcr8Q9EQM6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Dgcr8Q9EQM6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dgcr8Q9EQM6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dgcr8Q9EQM6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dgcr8Q9EQM6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Dgcr8Q9EQM6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dgcr8Q9EQM6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dgcr8Q9EQM6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dgcr8Q9EQM6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dgcr8Q9EQM6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dgcr8Q9EQM6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dgcr8Q9EQM6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dgcr8Q9EQM6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dgcr8Q9EQM6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dgcr8Q9EQM6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dgcr8Q9EQM6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dgcr8Q9EQM6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dgcr8Q9EQM6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dgcr8Q9EQM6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dgcr8Q9EQM6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dgcr8Q9EQM6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dgcr8Q9EQM6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dgcr8Q9EQM6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dgcr8Q9EQM6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dgcr8Q9EQM6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dgcr8Q9EQM6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dgcr8Q9EQM6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dgcr8Q9EQM6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dgcr8Q9EQM6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dgcr8Q9EQM6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dgcr8Q9EQM6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dgcr8Q9EQM6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dgcr8Q9EQM6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dgcr8Q9EQM6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dgcr8Q9EQM6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dgcr8Q9EQM6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dgcr8Q9EQM6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dgcr8Q9EQM6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dgcr8Q9EQM6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dgcr8Q9EQM6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Dgcr8Q9EQM6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dgcr8Q9EQM6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dgcr8Q9EQM6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dgcr8Q9EQM6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dgcr8Q9EQM6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dgcr8Q9EQM6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dgcr8Q9EQM6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dgcr8Q9EQM6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dgcr8Q9EQM6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dgcr8Q9EQM6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dgcr8Q9EQM6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dgcr8Q9EQM6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dgcr8Q9EQM6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dgcr8Q9EQM6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dgcr8Q9EQM6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dgcr8Q9EQM6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dgcr8Q9EQM6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dgcr8Q9EQM6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dgcr8Q9EQM6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dgcr8Q9EQM6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dgcr8Q9EQM6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dgcr8Q9EQM6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dgcr8Q9EQM6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dgcr8Q9EQM6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dgcr8Q9EQM6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dgcr8Q9EQM6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dgcr8Q9EQM6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dgcr8Q9EQM6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dgcr8Q9EQM6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Dgcr8Q9EQM6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dgcr8Q9EQM6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dgcr8Q9EQM6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dgcr8Q9EQM6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Dgcr8Q9EQM6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dgcr8Q9EQM6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dgcr8Q9EQM6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dgcr8Q9EQM6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dgcr8Q9EQM6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dgcr8Q9EQM6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dgcr8Q9EQM6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dgcr8Q9EQM6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dgcr8Q9EQM6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dgcr8Q9EQM6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dgcr8Q9EQM6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dgcr8Q9EQM6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms