Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQG9

Col4a3bp, Collagen type IV alpha-3-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3bpQ9EQG9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col4a3bpQ9EQG9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col4a3bpQ9EQG9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Col4a3bpQ9EQG9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col4a3bpQ9EQG9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col4a3bpQ9EQG9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col4a3bpQ9EQG9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col4a3bpQ9EQG9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col4a3bpQ9EQG9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col4a3bpQ9EQG9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col4a3bpQ9EQG9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Col4a3bpQ9EQG9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col4a3bpQ9EQG9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col4a3bpQ9EQG9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Col4a3bpQ9EQG9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Col4a3bpQ9EQG9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col4a3bpQ9EQG9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col4a3bpQ9EQG9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col4a3bpQ9EQG9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col4a3bpQ9EQG9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col4a3bpQ9EQG9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col4a3bpQ9EQG9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col4a3bpQ9EQG9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col4a3bpQ9EQG9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col4a3bpQ9EQG9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col4a3bpQ9EQG9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col4a3bpQ9EQG9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col4a3bpQ9EQG9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col4a3bpQ9EQG9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col4a3bpQ9EQG9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col4a3bpQ9EQG9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col4a3bpQ9EQG9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col4a3bpQ9EQG9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col4a3bpQ9EQG9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col4a3bpQ9EQG9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col4a3bpQ9EQG9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col4a3bpQ9EQG9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col4a3bpQ9EQG9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col4a3bpQ9EQG9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col4a3bpQ9EQG9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col4a3bpQ9EQG9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col4a3bpQ9EQG9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col4a3bpQ9EQG9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col4a3bpQ9EQG9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col4a3bpQ9EQG9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col4a3bpQ9EQG9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col4a3bpQ9EQG9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col4a3bpQ9EQG9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col4a3bpQ9EQG9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col4a3bpQ9EQG9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col4a3bpQ9EQG9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col4a3bpQ9EQG9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col4a3bpQ9EQG9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col4a3bpQ9EQG9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col4a3bpQ9EQG9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col4a3bpQ9EQG9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col4a3bpQ9EQG9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col4a3bpQ9EQG9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col4a3bpQ9EQG9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col4a3bpQ9EQG9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col4a3bpQ9EQG9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col4a3bpQ9EQG9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col4a3bpQ9EQG9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col4a3bpQ9EQG9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col4a3bpQ9EQG9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col4a3bpQ9EQG9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col4a3bpQ9EQG9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col4a3bpQ9EQG9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col4a3bpQ9EQG9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col4a3bpQ9EQG9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col4a3bpQ9EQG9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col4a3bpQ9EQG9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Col4a3bpQ9EQG9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col4a3bpQ9EQG9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Col4a3bpQ9EQG9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Col4a3bpQ9EQG9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col4a3bpQ9EQG9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col4a3bpQ9EQG9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col4a3bpQ9EQG9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col4a3bpQ9EQG9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col4a3bpQ9EQG9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col4a3bpQ9EQG9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col4a3bpQ9EQG9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col4a3bpQ9EQG9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col4a3bpQ9EQG9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col4a3bpQ9EQG9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col4a3bpQ9EQG9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col4a3bpQ9EQG9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col4a3bpQ9EQG9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col4a3bpQ9EQG9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col4a3bpQ9EQG9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col4a3bpQ9EQG9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col4a3bpQ9EQG9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col4a3bpQ9EQG9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col4a3bpQ9EQG9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col4a3bpQ9EQG9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col4a3bpQ9EQG9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col4a3bpQ9EQG9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col4a3bpQ9EQG9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col4a3bpQ9EQG9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms