Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ00

Ropn1l, Ropporin-1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1lQ9EQ00 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ropn1lQ9EQ00 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ropn1lQ9EQ00 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ropn1lQ9EQ00 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ropn1lQ9EQ00 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ropn1lQ9EQ00 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ropn1lQ9EQ00 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ropn1lQ9EQ00 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ropn1lQ9EQ00 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ropn1lQ9EQ00 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ropn1lQ9EQ00 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ropn1lQ9EQ00 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ropn1lQ9EQ00 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ropn1lQ9EQ00 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ropn1lQ9EQ00 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ropn1lQ9EQ00 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ropn1lQ9EQ00 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ropn1lQ9EQ00 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ropn1lQ9EQ00 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ropn1lQ9EQ00 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ropn1lQ9EQ00 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ropn1lQ9EQ00 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ropn1lQ9EQ00 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ropn1lQ9EQ00 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ropn1lQ9EQ00 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ropn1lQ9EQ00 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ropn1lQ9EQ00 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ropn1lQ9EQ00 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ropn1lQ9EQ00 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ropn1lQ9EQ00 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ropn1lQ9EQ00 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ropn1lQ9EQ00 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ropn1lQ9EQ00 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ropn1lQ9EQ00 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ropn1lQ9EQ00 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ropn1lQ9EQ00 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ropn1lQ9EQ00 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ropn1lQ9EQ00 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ropn1lQ9EQ00 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ropn1lQ9EQ00 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ropn1lQ9EQ00 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ropn1lQ9EQ00 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ropn1lQ9EQ00 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ropn1lQ9EQ00 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ropn1lQ9EQ00 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ropn1lQ9EQ00 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ropn1lQ9EQ00 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ropn1lQ9EQ00 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ropn1lQ9EQ00 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ropn1lQ9EQ00 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ropn1lQ9EQ00 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ropn1lQ9EQ00 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ropn1lQ9EQ00 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ropn1lQ9EQ00 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ropn1lQ9EQ00 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ropn1lQ9EQ00 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ropn1lQ9EQ00 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ropn1lQ9EQ00 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ropn1lQ9EQ00 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ropn1lQ9EQ00 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ropn1lQ9EQ00 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ropn1lQ9EQ00 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ropn1lQ9EQ00 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ropn1lQ9EQ00 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ropn1lQ9EQ00 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ropn1lQ9EQ00 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ropn1lQ9EQ00 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ropn1lQ9EQ00 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ropn1lQ9EQ00 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ropn1lQ9EQ00 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ropn1lQ9EQ00 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ropn1lQ9EQ00 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ropn1lQ9EQ00 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ropn1lQ9EQ00 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ropn1lQ9EQ00 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ropn1lQ9EQ00 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ropn1lQ9EQ00 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ropn1lQ9EQ00 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ropn1lQ9EQ00 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ropn1lQ9EQ00 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ropn1lQ9EQ00 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ropn1lQ9EQ00 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ropn1lQ9EQ00 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ropn1lQ9EQ00 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ropn1lQ9EQ00 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ropn1lQ9EQ00 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ropn1lQ9EQ00 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ropn1lQ9EQ00 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ropn1lQ9EQ00 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ropn1lQ9EQ00 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ropn1lQ9EQ00 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ropn1lQ9EQ00 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ropn1lQ9EQ00 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ropn1lQ9EQ00 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ropn1lQ9EQ00 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ropn1lQ9EQ00 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ropn1lQ9EQ00 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ropn1lQ9EQ00 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ropn1lQ9EQ00 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ropn1lQ9EQ00 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms