Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU4

Cpsf1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf1Q9EPU4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cpsf1Q9EPU4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cpsf1Q9EPU4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cpsf1Q9EPU4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cpsf1Q9EPU4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cpsf1Q9EPU4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cpsf1Q9EPU4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cpsf1Q9EPU4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cpsf1Q9EPU4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cpsf1Q9EPU4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cpsf1Q9EPU4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cpsf1Q9EPU4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Cpsf1Q9EPU4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cpsf1Q9EPU4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cpsf1Q9EPU4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cpsf1Q9EPU4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cpsf1Q9EPU4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cpsf1Q9EPU4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Cpsf1Q9EPU4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Cpsf1Q9EPU4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Cpsf1Q9EPU4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cpsf1Q9EPU4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cpsf1Q9EPU4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cpsf1Q9EPU4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cpsf1Q9EPU4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cpsf1Q9EPU4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cpsf1Q9EPU4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cpsf1Q9EPU4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cpsf1Q9EPU4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cpsf1Q9EPU4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cpsf1Q9EPU4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cpsf1Q9EPU4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cpsf1Q9EPU4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cpsf1Q9EPU4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cpsf1Q9EPU4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cpsf1Q9EPU4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cpsf1Q9EPU4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cpsf1Q9EPU4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cpsf1Q9EPU4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cpsf1Q9EPU4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cpsf1Q9EPU4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cpsf1Q9EPU4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cpsf1Q9EPU4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cpsf1Q9EPU4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cpsf1Q9EPU4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cpsf1Q9EPU4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cpsf1Q9EPU4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cpsf1Q9EPU4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cpsf1Q9EPU4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cpsf1Q9EPU4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cpsf1Q9EPU4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cpsf1Q9EPU4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cpsf1Q9EPU4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cpsf1Q9EPU4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cpsf1Q9EPU4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cpsf1Q9EPU4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cpsf1Q9EPU4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cpsf1Q9EPU4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cpsf1Q9EPU4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cpsf1Q9EPU4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cpsf1Q9EPU4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cpsf1Q9EPU4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cpsf1Q9EPU4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cpsf1Q9EPU4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cpsf1Q9EPU4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cpsf1Q9EPU4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cpsf1Q9EPU4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cpsf1Q9EPU4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Cpsf1Q9EPU4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cpsf1Q9EPU4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cpsf1Q9EPU4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cpsf1Q9EPU4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cpsf1Q9EPU4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cpsf1Q9EPU4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cpsf1Q9EPU4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cpsf1Q9EPU4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cpsf1Q9EPU4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cpsf1Q9EPU4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cpsf1Q9EPU4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cpsf1Q9EPU4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cpsf1Q9EPU4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cpsf1Q9EPU4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cpsf1Q9EPU4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cpsf1Q9EPU4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cpsf1Q9EPU4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cpsf1Q9EPU4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cpsf1Q9EPU4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cpsf1Q9EPU4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cpsf1Q9EPU4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Cpsf1Q9EPU4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cpsf1Q9EPU4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cpsf1Q9EPU4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cpsf1Q9EPU4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cpsf1Q9EPU4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cpsf1Q9EPU4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cpsf1Q9EPU4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cpsf1Q9EPU4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cpsf1Q9EPU4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Cpsf1Q9EPU4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cpsf1Q9EPU4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms