Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Rpgrip1Q9EPQ2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Rpgrip1Q9EPQ2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Rpgrip1Q9EPQ2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Rpgrip1Q9EPQ2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
Rpgrip1Q9EPQ2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Rpgrip1Q9EPQ2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Rpgrip1Q9EPQ2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms