Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT6

Bap18, Chromatin complexes subunit BAP18, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bap18Q9DCT6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bap18Q9DCT6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bap18Q9DCT6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bap18Q9DCT6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bap18Q9DCT6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bap18Q9DCT6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bap18Q9DCT6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bap18Q9DCT6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bap18Q9DCT6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bap18Q9DCT6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bap18Q9DCT6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bap18Q9DCT6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bap18Q9DCT6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bap18Q9DCT6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bap18Q9DCT6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bap18Q9DCT6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bap18Q9DCT6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bap18Q9DCT6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Bap18Q9DCT6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Bap18Q9DCT6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bap18Q9DCT6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bap18Q9DCT6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bap18Q9DCT6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bap18Q9DCT6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bap18Q9DCT6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bap18Q9DCT6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bap18Q9DCT6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bap18Q9DCT6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms