Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCJ5

Ndufa8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa8Q9DCJ5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndufa8Q9DCJ5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ndufa8Q9DCJ5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ndufa8Q9DCJ5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ndufa8Q9DCJ5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ndufa8Q9DCJ5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ndufa8Q9DCJ5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ndufa8Q9DCJ5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ndufa8Q9DCJ5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ndufa8Q9DCJ5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ndufa8Q9DCJ5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ndufa8Q9DCJ5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ndufa8Q9DCJ5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ndufa8Q9DCJ5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ndufa8Q9DCJ5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ndufa8Q9DCJ5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ndufa8Q9DCJ5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ndufa8Q9DCJ5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ndufa8Q9DCJ5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ndufa8Q9DCJ5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ndufa8Q9DCJ5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ndufa8Q9DCJ5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ndufa8Q9DCJ5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ndufa8Q9DCJ5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ndufa8Q9DCJ5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ndufa8Q9DCJ5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ndufa8Q9DCJ5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ndufa8Q9DCJ5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ndufa8Q9DCJ5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ndufa8Q9DCJ5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ndufa8Q9DCJ5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ndufa8Q9DCJ5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ndufa8Q9DCJ5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ndufa8Q9DCJ5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ndufa8Q9DCJ5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ndufa8Q9DCJ5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ndufa8Q9DCJ5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ndufa8Q9DCJ5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ndufa8Q9DCJ5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ndufa8Q9DCJ5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ndufa8Q9DCJ5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ndufa8Q9DCJ5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ndufa8Q9DCJ5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ndufa8Q9DCJ5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ndufa8Q9DCJ5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ndufa8Q9DCJ5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ndufa8Q9DCJ5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ndufa8Q9DCJ5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ndufa8Q9DCJ5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ndufa8Q9DCJ5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ndufa8Q9DCJ5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ndufa8Q9DCJ5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ndufa8Q9DCJ5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ndufa8Q9DCJ5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ndufa8Q9DCJ5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ndufa8Q9DCJ5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ndufa8Q9DCJ5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ndufa8Q9DCJ5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ndufa8Q9DCJ5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ndufa8Q9DCJ5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ndufa8Q9DCJ5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ndufa8Q9DCJ5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ndufa8Q9DCJ5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ndufa8Q9DCJ5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ndufa8Q9DCJ5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ndufa8Q9DCJ5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ndufa8Q9DCJ5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ndufa8Q9DCJ5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ndufa8Q9DCJ5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ndufa8Q9DCJ5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ndufa8Q9DCJ5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ndufa8Q9DCJ5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ndufa8Q9DCJ5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ndufa8Q9DCJ5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ndufa8Q9DCJ5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ndufa8Q9DCJ5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ndufa8Q9DCJ5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ndufa8Q9DCJ5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ndufa8Q9DCJ5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ndufa8Q9DCJ5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ndufa8Q9DCJ5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ndufa8Q9DCJ5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ndufa8Q9DCJ5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ndufa8Q9DCJ5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ndufa8Q9DCJ5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ndufa8Q9DCJ5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ndufa8Q9DCJ5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ndufa8Q9DCJ5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ndufa8Q9DCJ5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ndufa8Q9DCJ5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ndufa8Q9DCJ5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ndufa8Q9DCJ5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ndufa8Q9DCJ5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ndufa8Q9DCJ5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ndufa8Q9DCJ5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ndufa8Q9DCJ5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ndufa8Q9DCJ5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ndufa8Q9DCJ5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ndufa8Q9DCJ5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ndufa8Q9DCJ5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 318.5 ms