Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC29

Abcb6, ATP-binding cassette sub-family B member 6, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb6Q9DC29 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Abcb6Q9DC29 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcb6Q9DC29 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcb6Q9DC29 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcb6Q9DC29 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcb6Q9DC29 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcb6Q9DC29 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcb6Q9DC29 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcb6Q9DC29 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcb6Q9DC29 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcb6Q9DC29 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcb6Q9DC29 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcb6Q9DC29 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcb6Q9DC29 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcb6Q9DC29 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcb6Q9DC29 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcb6Q9DC29 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcb6Q9DC29 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcb6Q9DC29 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcb6Q9DC29 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcb6Q9DC29 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcb6Q9DC29 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcb6Q9DC29 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcb6Q9DC29 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcb6Q9DC29 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcb6Q9DC29 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcb6Q9DC29 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcb6Q9DC29 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcb6Q9DC29 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcb6Q9DC29 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcb6Q9DC29 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcb6Q9DC29 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcb6Q9DC29 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcb6Q9DC29 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcb6Q9DC29 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcb6Q9DC29 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcb6Q9DC29 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcb6Q9DC29 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcb6Q9DC29 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcb6Q9DC29 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcb6Q9DC29 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcb6Q9DC29 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcb6Q9DC29 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcb6Q9DC29 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcb6Q9DC29 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcb6Q9DC29 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcb6Q9DC29 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcb6Q9DC29 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcb6Q9DC29 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcb6Q9DC29 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcb6Q9DC29 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcb6Q9DC29 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcb6Q9DC29 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcb6Q9DC29 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcb6Q9DC29 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Abcb6Q9DC29 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcb6Q9DC29 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcb6Q9DC29 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcb6Q9DC29 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcb6Q9DC29 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcb6Q9DC29 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcb6Q9DC29 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcb6Q9DC29 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcb6Q9DC29 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcb6Q9DC29 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Abcb6Q9DC29 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcb6Q9DC29 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Abcb6Q9DC29 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Abcb6Q9DC29 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcb6Q9DC29 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcb6Q9DC29 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcb6Q9DC29 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcb6Q9DC29 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcb6Q9DC29 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcb6Q9DC29 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcb6Q9DC29 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcb6Q9DC29 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcb6Q9DC29 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcb6Q9DC29 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcb6Q9DC29 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcb6Q9DC29 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcb6Q9DC29 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcb6Q9DC29 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcb6Q9DC29 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcb6Q9DC29 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcb6Q9DC29 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcb6Q9DC29 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcb6Q9DC29 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcb6Q9DC29 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcb6Q9DC29 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcb6Q9DC29 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcb6Q9DC29 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcb6Q9DC29 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcb6Q9DC29 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcb6Q9DC29 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcb6Q9DC29 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcb6Q9DC29 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcb6Q9DC29 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcb6Q9DC29 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcb6Q9DC29 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 230.7 ms