Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pop5Q9DB28 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pop5Q9DB28 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pop5Q9DB28 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pop5Q9DB28 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pop5Q9DB28 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pop5Q9DB28 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pop5Q9DB28 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pop5Q9DB28 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pop5Q9DB28 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pop5Q9DB28 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pop5Q9DB28 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pop5Q9DB28 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pop5Q9DB28 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pop5Q9DB28 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pop5Q9DB28 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pop5Q9DB28 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pop5Q9DB28 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pop5Q9DB28 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pop5Q9DB28 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pop5Q9DB28 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pop5Q9DB28 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pop5Q9DB28 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pop5Q9DB28 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pop5Q9DB28 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pop5Q9DB28 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pop5Q9DB28 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pop5Q9DB28 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pop5Q9DB28 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pop5Q9DB28 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pop5Q9DB28 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pop5Q9DB28 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pop5Q9DB28 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pop5Q9DB28 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pop5Q9DB28 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pop5Q9DB28 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pop5Q9DB28 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pop5Q9DB28 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pop5Q9DB28 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pop5Q9DB28 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pop5Q9DB28 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pop5Q9DB28 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pop5Q9DB28 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pop5Q9DB28 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pop5Q9DB28 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pop5Q9DB28 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pop5Q9DB28 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pop5Q9DB28 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pop5Q9DB28 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pop5Q9DB28 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pop5Q9DB28 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pop5Q9DB28 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pop5Q9DB28 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pop5Q9DB28 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pop5Q9DB28 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pop5Q9DB28 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Pop5Q9DB28 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pop5Q9DB28 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pop5Q9DB28 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pop5Q9DB28 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pop5Q9DB28 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pop5Q9DB28 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pop5Q9DB28 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pop5Q9DB28 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pop5Q9DB28 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pop5Q9DB28 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pop5Q9DB28 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pop5Q9DB28 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pop5Q9DB28 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pop5Q9DB28 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pop5Q9DB28 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pop5Q9DB28 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pop5Q9DB28 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pop5Q9DB28 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pop5Q9DB28 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pop5Q9DB28 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pop5Q9DB28 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pop5Q9DB28 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pop5Q9DB28 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pop5Q9DB28 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pop5Q9DB28 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pop5Q9DB28 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pop5Q9DB28 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pop5Q9DB28 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pop5Q9DB28 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Pop5Q9DB28 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pop5Q9DB28 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pop5Q9DB28 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pop5Q9DB28 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pop5Q9DB28 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pop5Q9DB28 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pop5Q9DB28 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pop5Q9DB28 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pop5Q9DB28 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pop5Q9DB28 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pop5Q9DB28 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pop5Q9DB28 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pop5Q9DB28 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pop5Q9DB28 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pop5Q9DB28 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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