Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAH1

Scp2d1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scp2d1Q9DAH1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scp2d1Q9DAH1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scp2d1Q9DAH1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scp2d1Q9DAH1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Scp2d1Q9DAH1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scp2d1Q9DAH1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scp2d1Q9DAH1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scp2d1Q9DAH1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scp2d1Q9DAH1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scp2d1Q9DAH1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scp2d1Q9DAH1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scp2d1Q9DAH1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scp2d1Q9DAH1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scp2d1Q9DAH1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scp2d1Q9DAH1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scp2d1Q9DAH1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scp2d1Q9DAH1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scp2d1Q9DAH1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scp2d1Q9DAH1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scp2d1Q9DAH1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scp2d1Q9DAH1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scp2d1Q9DAH1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Scp2d1Q9DAH1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scp2d1Q9DAH1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scp2d1Q9DAH1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scp2d1Q9DAH1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scp2d1Q9DAH1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scp2d1Q9DAH1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scp2d1Q9DAH1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scp2d1Q9DAH1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scp2d1Q9DAH1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scp2d1Q9DAH1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scp2d1Q9DAH1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scp2d1Q9DAH1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scp2d1Q9DAH1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scp2d1Q9DAH1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Scp2d1Q9DAH1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scp2d1Q9DAH1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scp2d1Q9DAH1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scp2d1Q9DAH1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scp2d1Q9DAH1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scp2d1Q9DAH1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Scp2d1Q9DAH1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Scp2d1Q9DAH1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scp2d1Q9DAH1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scp2d1Q9DAH1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scp2d1Q9DAH1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scp2d1Q9DAH1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scp2d1Q9DAH1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scp2d1Q9DAH1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scp2d1Q9DAH1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scp2d1Q9DAH1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scp2d1Q9DAH1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scp2d1Q9DAH1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scp2d1Q9DAH1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scp2d1Q9DAH1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scp2d1Q9DAH1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scp2d1Q9DAH1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scp2d1Q9DAH1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scp2d1Q9DAH1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scp2d1Q9DAH1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scp2d1Q9DAH1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scp2d1Q9DAH1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scp2d1Q9DAH1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Scp2d1Q9DAH1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scp2d1Q9DAH1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scp2d1Q9DAH1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scp2d1Q9DAH1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scp2d1Q9DAH1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scp2d1Q9DAH1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scp2d1Q9DAH1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scp2d1Q9DAH1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scp2d1Q9DAH1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scp2d1Q9DAH1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scp2d1Q9DAH1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scp2d1Q9DAH1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scp2d1Q9DAH1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scp2d1Q9DAH1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scp2d1Q9DAH1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scp2d1Q9DAH1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms