Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc89Q9DA73 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc89Q9DA73 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc89Q9DA73 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc89Q9DA73 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc89Q9DA73 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc89Q9DA73 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc89Q9DA73 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc89Q9DA73 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc89Q9DA73 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc89Q9DA73 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc89Q9DA73 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc89Q9DA73 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc89Q9DA73 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc89Q9DA73 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc89Q9DA73 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc89Q9DA73 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc89Q9DA73 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc89Q9DA73 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc89Q9DA73 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc89Q9DA73 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc89Q9DA73 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc89Q9DA73 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc89Q9DA73 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc89Q9DA73 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc89Q9DA73 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc89Q9DA73 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc89Q9DA73 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc89Q9DA73 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc89Q9DA73 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc89Q9DA73 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc89Q9DA73 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc89Q9DA73 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc89Q9DA73 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc89Q9DA73 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc89Q9DA73 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc89Q9DA73 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc89Q9DA73 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc89Q9DA73 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc89Q9DA73 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc89Q9DA73 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc89Q9DA73 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc89Q9DA73 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc89Q9DA73 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc89Q9DA73 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc89Q9DA73 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc89Q9DA73 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc89Q9DA73 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc89Q9DA73 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc89Q9DA73 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc89Q9DA73 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc89Q9DA73 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc89Q9DA73 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc89Q9DA73 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc89Q9DA73 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc89Q9DA73 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc89Q9DA73 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc89Q9DA73 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc89Q9DA73 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc89Q9DA73 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc89Q9DA73 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc89Q9DA73 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc89Q9DA73 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccdc89Q9DA73 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc89Q9DA73 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc89Q9DA73 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc89Q9DA73 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc89Q9DA73 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc89Q9DA73 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc89Q9DA73 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc89Q9DA73 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc89Q9DA73 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc89Q9DA73 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc89Q9DA73 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc89Q9DA73 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc89Q9DA73 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc89Q9DA73 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc89Q9DA73 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc89Q9DA73 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc89Q9DA73 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc89Q9DA73 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc89Q9DA73 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc89Q9DA73 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc89Q9DA73 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc89Q9DA73 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc89Q9DA73 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc89Q9DA73 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc89Q9DA73 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc89Q9DA73 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc89Q9DA73 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc89Q9DA73 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc89Q9DA73 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc89Q9DA73 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc89Q9DA73 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc89Q9DA73 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc89Q9DA73 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc89Q9DA73 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc89Q9DA73 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc89Q9DA73 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc89Q9DA73 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms