Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H8

UPF0565 protein C2orf69 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9H8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Q9D9H8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Q9D9H8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Q9D9H8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Q9D9H8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Q9D9H8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Q9D9H8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Q9D9H8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Q9D9H8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Q9D9H8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Q9D9H8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Q9D9H8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Q9D9H8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Q9D9H8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Q9D9H8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Q9D9H8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Q9D9H8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Q9D9H8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Q9D9H8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Q9D9H8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Q9D9H8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Q9D9H8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Q9D9H8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Q9D9H8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Q9D9H8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Q9D9H8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Q9D9H8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Q9D9H8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Q9D9H8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Q9D9H8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Q9D9H8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Q9D9H8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Q9D9H8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Q9D9H8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Q9D9H8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Q9D9H8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Q9D9H8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Q9D9H8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Q9D9H8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Q9D9H8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Q9D9H8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Q9D9H8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Q9D9H8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Q9D9H8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Q9D9H8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Q9D9H8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Q9D9H8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Q9D9H8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Q9D9H8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Q9D9H8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Q9D9H8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Q9D9H8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Q9D9H8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Q9D9H8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Q9D9H8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Q9D9H8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Q9D9H8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Q9D9H8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Q9D9H8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Q9D9H8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Q9D9H8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Q9D9H8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Q9D9H8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Q9D9H8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Q9D9H8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Q9D9H8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Q9D9H8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Q9D9H8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Q9D9H8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Q9D9H8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Q9D9H8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Q9D9H8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Q9D9H8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Q9D9H8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Q9D9H8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Q9D9H8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Q9D9H8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Q9D9H8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Q9D9H8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Q9D9H8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Q9D9H8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Q9D9H8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Q9D9H8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Q9D9H8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Q9D9H8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Q9D9H8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Q9D9H8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Q9D9H8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Q9D9H8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Q9D9H8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Q9D9H8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Q9D9H8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Q9D9H8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Q9D9H8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Q9D9H8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Q9D9H8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Q9D9H8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Q9D9H8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Q9D9H8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Q9D9H8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms