Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf3c6Q9D8P7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf3c6Q9D8P7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf3c6Q9D8P7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf3c6Q9D8P7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf3c6Q9D8P7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf3c6Q9D8P7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf3c6Q9D8P7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf3c6Q9D8P7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf3c6Q9D8P7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf3c6Q9D8P7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf3c6Q9D8P7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf3c6Q9D8P7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf3c6Q9D8P7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf3c6Q9D8P7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf3c6Q9D8P7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf3c6Q9D8P7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf3c6Q9D8P7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf3c6Q9D8P7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf3c6Q9D8P7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf3c6Q9D8P7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf3c6Q9D8P7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf3c6Q9D8P7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf3c6Q9D8P7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf3c6Q9D8P7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf3c6Q9D8P7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf3c6Q9D8P7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf3c6Q9D8P7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf3c6Q9D8P7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf3c6Q9D8P7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf3c6Q9D8P7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf3c6Q9D8P7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf3c6Q9D8P7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf3c6Q9D8P7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf3c6Q9D8P7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf3c6Q9D8P7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf3c6Q9D8P7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf3c6Q9D8P7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf3c6Q9D8P7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf3c6Q9D8P7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf3c6Q9D8P7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf3c6Q9D8P7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf3c6Q9D8P7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf3c6Q9D8P7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf3c6Q9D8P7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf3c6Q9D8P7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf3c6Q9D8P7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf3c6Q9D8P7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf3c6Q9D8P7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf3c6Q9D8P7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf3c6Q9D8P7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf3c6Q9D8P7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf3c6Q9D8P7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf3c6Q9D8P7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf3c6Q9D8P7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf3c6Q9D8P7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf3c6Q9D8P7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf3c6Q9D8P7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf3c6Q9D8P7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf3c6Q9D8P7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf3c6Q9D8P7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf3c6Q9D8P7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gtf3c6Q9D8P7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf3c6Q9D8P7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf3c6Q9D8P7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf3c6Q9D8P7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf3c6Q9D8P7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf3c6Q9D8P7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf3c6Q9D8P7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf3c6Q9D8P7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf3c6Q9D8P7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf3c6Q9D8P7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf3c6Q9D8P7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf3c6Q9D8P7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf3c6Q9D8P7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf3c6Q9D8P7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf3c6Q9D8P7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf3c6Q9D8P7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf3c6Q9D8P7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf3c6Q9D8P7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf3c6Q9D8P7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf3c6Q9D8P7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf3c6Q9D8P7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf3c6Q9D8P7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf3c6Q9D8P7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf3c6Q9D8P7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf3c6Q9D8P7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf3c6Q9D8P7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf3c6Q9D8P7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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