Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9D8N1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9D8N1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9D8N1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9D8N1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9D8N1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9D8N1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9D8N1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9D8N1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9D8N1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9D8N1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9D8N1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9D8N1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9D8N1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9D8N1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9D8N1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9D8N1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9D8N1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9D8N1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9D8N1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9D8N1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Q9D8N1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Q9D8N1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9D8N1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9D8N1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9D8N1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9D8N1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9D8N1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9D8N1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9D8N1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9D8N1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9D8N1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9D8N1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9D8N1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9D8N1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9D8N1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9D8N1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D8N1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D8N1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D8N1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D8N1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D8N1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D8N1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D8N1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D8N1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D8N1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D8N1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D8N1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D8N1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D8N1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D8N1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D8N1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D8N1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D8N1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D8N1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D8N1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D8N1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D8N1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D8N1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D8N1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D8N1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D8N1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D8N1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D8N1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D8N1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D8N1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D8N1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D8N1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D8N1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D8N1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D8N1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D8N1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D8N1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D8N1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D8N1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D8N1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D8N1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D8N1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D8N1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D8N1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D8N1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D8N1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D8N1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D8N1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D8N1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D8N1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D8N1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D8N1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D8N1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D8N1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q9D8N1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q9D8N1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q9D8N1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q9D8N1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q9D8N1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9D8N1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9D8N1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9D8N1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D8N1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D8N1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms