Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K8

Slc25a39, Solute carrier family 25 member 39, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc25a39Q9D8K8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc25a39Q9D8K8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc25a39Q9D8K8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc25a39Q9D8K8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc25a39Q9D8K8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc25a39Q9D8K8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc25a39Q9D8K8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc25a39Q9D8K8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc25a39Q9D8K8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc25a39Q9D8K8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc25a39Q9D8K8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc25a39Q9D8K8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc25a39Q9D8K8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc25a39Q9D8K8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc25a39Q9D8K8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc25a39Q9D8K8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc25a39Q9D8K8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc25a39Q9D8K8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc25a39Q9D8K8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc25a39Q9D8K8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc25a39Q9D8K8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc25a39Q9D8K8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc25a39Q9D8K8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc25a39Q9D8K8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc25a39Q9D8K8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc25a39Q9D8K8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc25a39Q9D8K8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc25a39Q9D8K8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc25a39Q9D8K8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc25a39Q9D8K8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc25a39Q9D8K8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc25a39Q9D8K8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc25a39Q9D8K8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc25a39Q9D8K8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc25a39Q9D8K8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc25a39Q9D8K8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc25a39Q9D8K8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc25a39Q9D8K8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc25a39Q9D8K8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc25a39Q9D8K8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc25a39Q9D8K8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc25a39Q9D8K8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc25a39Q9D8K8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc25a39Q9D8K8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc25a39Q9D8K8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc25a39Q9D8K8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc25a39Q9D8K8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc25a39Q9D8K8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc25a39Q9D8K8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc25a39Q9D8K8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc25a39Q9D8K8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc25a39Q9D8K8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc25a39Q9D8K8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc25a39Q9D8K8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc25a39Q9D8K8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc25a39Q9D8K8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc25a39Q9D8K8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc25a39Q9D8K8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc25a39Q9D8K8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc25a39Q9D8K8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc25a39Q9D8K8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc25a39Q9D8K8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc25a39Q9D8K8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc25a39Q9D8K8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc25a39Q9D8K8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc25a39Q9D8K8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc25a39Q9D8K8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc25a39Q9D8K8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc25a39Q9D8K8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc25a39Q9D8K8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc25a39Q9D8K8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc25a39Q9D8K8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc25a39Q9D8K8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc25a39Q9D8K8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc25a39Q9D8K8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc25a39Q9D8K8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc25a39Q9D8K8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc25a39Q9D8K8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc25a39Q9D8K8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc25a39Q9D8K8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc25a39Q9D8K8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc25a39Q9D8K8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc25a39Q9D8K8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc25a39Q9D8K8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc25a39Q9D8K8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc25a39Q9D8K8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc25a39Q9D8K8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc25a39Q9D8K8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc25a39Q9D8K8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc25a39Q9D8K8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc25a39Q9D8K8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc25a39Q9D8K8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc25a39Q9D8K8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc25a39Q9D8K8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc25a39Q9D8K8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc25a39Q9D8K8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc25a39Q9D8K8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc25a39Q9D8K8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc25a39Q9D8K8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc25a39Q9D8K8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms