Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms