Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Capn9Q9D805 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capn9Q9D805 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capn9Q9D805 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Capn9Q9D805 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capn9Q9D805 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capn9Q9D805 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capn9Q9D805 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capn9Q9D805 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capn9Q9D805 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capn9Q9D805 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Capn9Q9D805 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Capn9Q9D805 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Capn9Q9D805 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Capn9Q9D805 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Capn9Q9D805 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Capn9Q9D805 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Capn9Q9D805 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Capn9Q9D805 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Capn9Q9D805 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Capn9Q9D805 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Capn9Q9D805 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Capn9Q9D805 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Capn9Q9D805 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Capn9Q9D805 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Capn9Q9D805 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Capn9Q9D805 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Capn9Q9D805 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Capn9Q9D805 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Capn9Q9D805 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Capn9Q9D805 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Capn9Q9D805 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Capn9Q9D805 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Capn9Q9D805 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Capn9Q9D805 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Capn9Q9D805 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Capn9Q9D805 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Capn9Q9D805 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Capn9Q9D805 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Capn9Q9D805 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Capn9Q9D805 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Capn9Q9D805 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Capn9Q9D805 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Capn9Q9D805 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Capn9Q9D805 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Capn9Q9D805 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Capn9Q9D805 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Capn9Q9D805 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Capn9Q9D805 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Capn9Q9D805 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Capn9Q9D805 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Capn9Q9D805 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Capn9Q9D805 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Capn9Q9D805 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Capn9Q9D805 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Capn9Q9D805 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Capn9Q9D805 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Capn9Q9D805 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Capn9Q9D805 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Capn9Q9D805 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Capn9Q9D805 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Capn9Q9D805 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Capn9Q9D805 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Capn9Q9D805 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Capn9Q9D805 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Capn9Q9D805 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Capn9Q9D805 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Capn9Q9D805 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Capn9Q9D805 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Capn9Q9D805 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Capn9Q9D805 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Capn9Q9D805 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Capn9Q9D805 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Capn9Q9D805 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Capn9Q9D805 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Capn9Q9D805 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Capn9Q9D805 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Capn9Q9D805 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Capn9Q9D805 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Capn9Q9D805 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Capn9Q9D805 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Capn9Q9D805 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Capn9Q9D805 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Capn9Q9D805 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Capn9Q9D805 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Capn9Q9D805 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Capn9Q9D805 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Capn9Q9D805 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Capn9Q9D805 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Capn9Q9D805 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Capn9Q9D805 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Capn9Q9D805 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Capn9Q9D805 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Capn9Q9D805 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capn9Q9D805 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capn9Q9D805 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capn9Q9D805 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capn9Q9D805 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capn9Q9D805 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capn9Q9D805 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms