Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chmp5Q9D7S9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chmp5Q9D7S9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Chmp5Q9D7S9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chmp5Q9D7S9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chmp5Q9D7S9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chmp5Q9D7S9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chmp5Q9D7S9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chmp5Q9D7S9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chmp5Q9D7S9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chmp5Q9D7S9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chmp5Q9D7S9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chmp5Q9D7S9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chmp5Q9D7S9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chmp5Q9D7S9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chmp5Q9D7S9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chmp5Q9D7S9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chmp5Q9D7S9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chmp5Q9D7S9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chmp5Q9D7S9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chmp5Q9D7S9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chmp5Q9D7S9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chmp5Q9D7S9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chmp5Q9D7S9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chmp5Q9D7S9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chmp5Q9D7S9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chmp5Q9D7S9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chmp5Q9D7S9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Chmp5Q9D7S9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Chmp5Q9D7S9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Chmp5Q9D7S9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Chmp5Q9D7S9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Chmp5Q9D7S9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Chmp5Q9D7S9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chmp5Q9D7S9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chmp5Q9D7S9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chmp5Q9D7S9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chmp5Q9D7S9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chmp5Q9D7S9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chmp5Q9D7S9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chmp5Q9D7S9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chmp5Q9D7S9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chmp5Q9D7S9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chmp5Q9D7S9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chmp5Q9D7S9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chmp5Q9D7S9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chmp5Q9D7S9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chmp5Q9D7S9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chmp5Q9D7S9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chmp5Q9D7S9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Chmp5Q9D7S9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chmp5Q9D7S9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chmp5Q9D7S9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chmp5Q9D7S9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chmp5Q9D7S9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chmp5Q9D7S9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chmp5Q9D7S9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chmp5Q9D7S9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chmp5Q9D7S9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chmp5Q9D7S9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Chmp5Q9D7S9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chmp5Q9D7S9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chmp5Q9D7S9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chmp5Q9D7S9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chmp5Q9D7S9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chmp5Q9D7S9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chmp5Q9D7S9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chmp5Q9D7S9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chmp5Q9D7S9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chmp5Q9D7S9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chmp5Q9D7S9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chmp5Q9D7S9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chmp5Q9D7S9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chmp5Q9D7S9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chmp5Q9D7S9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chmp5Q9D7S9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chmp5Q9D7S9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chmp5Q9D7S9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chmp5Q9D7S9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chmp5Q9D7S9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chmp5Q9D7S9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chmp5Q9D7S9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chmp5Q9D7S9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chmp5Q9D7S9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chmp5Q9D7S9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Chmp5Q9D7S9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Chmp5Q9D7S9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chmp5Q9D7S9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chmp5Q9D7S9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chmp5Q9D7S9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chmp5Q9D7S9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chmp5Q9D7S9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chmp5Q9D7S9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chmp5Q9D7S9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chmp5Q9D7S9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chmp5Q9D7S9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chmp5Q9D7S9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chmp5Q9D7S9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chmp5Q9D7S9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chmp5Q9D7S9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms