Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6P8

Calml3, Calmodulin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calml3Q9D6P8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Calml3Q9D6P8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Calml3Q9D6P8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Calml3Q9D6P8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Calml3Q9D6P8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Calml3Q9D6P8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Calml3Q9D6P8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Calml3Q9D6P8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Calml3Q9D6P8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Calml3Q9D6P8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Calml3Q9D6P8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Calml3Q9D6P8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Calml3Q9D6P8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Calml3Q9D6P8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Calml3Q9D6P8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Calml3Q9D6P8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Calml3Q9D6P8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Calml3Q9D6P8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Calml3Q9D6P8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Calml3Q9D6P8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Calml3Q9D6P8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Calml3Q9D6P8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Calml3Q9D6P8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Calml3Q9D6P8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Calml3Q9D6P8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Calml3Q9D6P8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Calml3Q9D6P8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Calml3Q9D6P8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Calml3Q9D6P8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Calml3Q9D6P8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Calml3Q9D6P8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Calml3Q9D6P8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Calml3Q9D6P8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Calml3Q9D6P8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Calml3Q9D6P8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Calml3Q9D6P8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Calml3Q9D6P8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Calml3Q9D6P8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Calml3Q9D6P8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Calml3Q9D6P8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Calml3Q9D6P8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Calml3Q9D6P8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Calml3Q9D6P8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Calml3Q9D6P8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Calml3Q9D6P8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Calml3Q9D6P8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Calml3Q9D6P8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Calml3Q9D6P8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Calml3Q9D6P8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Calml3Q9D6P8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Calml3Q9D6P8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Calml3Q9D6P8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Calml3Q9D6P8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Calml3Q9D6P8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Calml3Q9D6P8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Calml3Q9D6P8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Calml3Q9D6P8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Calml3Q9D6P8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Calml3Q9D6P8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Calml3Q9D6P8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Calml3Q9D6P8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Calml3Q9D6P8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Calml3Q9D6P8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Calml3Q9D6P8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Calml3Q9D6P8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Calml3Q9D6P8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Calml3Q9D6P8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Calml3Q9D6P8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Calml3Q9D6P8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Calml3Q9D6P8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Calml3Q9D6P8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Calml3Q9D6P8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Calml3Q9D6P8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Calml3Q9D6P8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Calml3Q9D6P8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Calml3Q9D6P8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Calml3Q9D6P8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Calml3Q9D6P8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Calml3Q9D6P8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Calml3Q9D6P8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Calml3Q9D6P8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Calml3Q9D6P8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Calml3Q9D6P8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Calml3Q9D6P8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Calml3Q9D6P8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Calml3Q9D6P8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Calml3Q9D6P8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Calml3Q9D6P8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Calml3Q9D6P8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Calml3Q9D6P8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Calml3Q9D6P8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Calml3Q9D6P8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Calml3Q9D6P8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Calml3Q9D6P8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Calml3Q9D6P8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Calml3Q9D6P8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Calml3Q9D6P8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Calml3Q9D6P8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Calml3Q9D6P8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Calml3Q9D6P8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms