Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc9bQ9D6E4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc9bQ9D6E4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc9bQ9D6E4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc9bQ9D6E4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc9bQ9D6E4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc9bQ9D6E4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc9bQ9D6E4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc9bQ9D6E4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc9bQ9D6E4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc9bQ9D6E4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc9bQ9D6E4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc9bQ9D6E4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc9bQ9D6E4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc9bQ9D6E4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc9bQ9D6E4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc9bQ9D6E4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc9bQ9D6E4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc9bQ9D6E4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc9bQ9D6E4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc9bQ9D6E4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc9bQ9D6E4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc9bQ9D6E4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc9bQ9D6E4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc9bQ9D6E4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc9bQ9D6E4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc9bQ9D6E4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc9bQ9D6E4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc9bQ9D6E4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc9bQ9D6E4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc9bQ9D6E4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc9bQ9D6E4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc9bQ9D6E4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc9bQ9D6E4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc9bQ9D6E4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc9bQ9D6E4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc9bQ9D6E4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc9bQ9D6E4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ttc9bQ9D6E4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Ttc9bQ9D6E4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ttc9bQ9D6E4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ttc9bQ9D6E4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Ttc9bQ9D6E4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc9bQ9D6E4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc9bQ9D6E4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc9bQ9D6E4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc9bQ9D6E4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc9bQ9D6E4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc9bQ9D6E4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc9bQ9D6E4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc9bQ9D6E4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc9bQ9D6E4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc9bQ9D6E4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc9bQ9D6E4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc9bQ9D6E4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc9bQ9D6E4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc9bQ9D6E4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc9bQ9D6E4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc9bQ9D6E4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc9bQ9D6E4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc9bQ9D6E4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc9bQ9D6E4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc9bQ9D6E4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc9bQ9D6E4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc9bQ9D6E4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc9bQ9D6E4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc9bQ9D6E4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc9bQ9D6E4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc9bQ9D6E4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc9bQ9D6E4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc9bQ9D6E4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc9bQ9D6E4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc9bQ9D6E4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc9bQ9D6E4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc9bQ9D6E4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc9bQ9D6E4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc9bQ9D6E4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc9bQ9D6E4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc9bQ9D6E4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc9bQ9D6E4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc9bQ9D6E4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc9bQ9D6E4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc9bQ9D6E4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc9bQ9D6E4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc9bQ9D6E4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc9bQ9D6E4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc9bQ9D6E4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc9bQ9D6E4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc9bQ9D6E4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc9bQ9D6E4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc9bQ9D6E4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc9bQ9D6E4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc9bQ9D6E4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc9bQ9D6E4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc9bQ9D6E4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc9bQ9D6E4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc9bQ9D6E4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc9bQ9D6E4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc9bQ9D6E4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc9bQ9D6E4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms