Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc7Q9D541 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc7Q9D541 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc7Q9D541 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc7Q9D541 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc7Q9D541 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc7Q9D541 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc7Q9D541 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc7Q9D541 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc7Q9D541 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc7Q9D541 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc7Q9D541 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc7Q9D541 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc7Q9D541 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc7Q9D541 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc7Q9D541 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc7Q9D541 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc7Q9D541 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc7Q9D541 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc7Q9D541 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc7Q9D541 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc7Q9D541 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc7Q9D541 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc7Q9D541 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc7Q9D541 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc7Q9D541 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc7Q9D541 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc7Q9D541 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc7Q9D541 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc7Q9D541 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc7Q9D541 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc7Q9D541 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc7Q9D541 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc7Q9D541 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc7Q9D541 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc7Q9D541 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc7Q9D541 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc7Q9D541 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc7Q9D541 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc7Q9D541 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc7Q9D541 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc7Q9D541 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc7Q9D541 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc7Q9D541 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc7Q9D541 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc7Q9D541 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc7Q9D541 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc7Q9D541 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc7Q9D541 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc7Q9D541 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc7Q9D541 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc7Q9D541 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc7Q9D541 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc7Q9D541 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc7Q9D541 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc7Q9D541 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc7Q9D541 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc7Q9D541 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc7Q9D541 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc7Q9D541 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc7Q9D541 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc7Q9D541 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc7Q9D541 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc7Q9D541 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc7Q9D541 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc7Q9D541 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc7Q9D541 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc7Q9D541 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc7Q9D541 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc7Q9D541 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc7Q9D541 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc7Q9D541 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc7Q9D541 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc7Q9D541 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc7Q9D541 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc7Q9D541 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc7Q9D541 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc7Q9D541 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc7Q9D541 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc7Q9D541 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc7Q9D541 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc7Q9D541 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc7Q9D541 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc7Q9D541 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc7Q9D541 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc7Q9D541 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc7Q9D541 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc7Q9D541 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc7Q9D541 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc7Q9D541 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc7Q9D541 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc7Q9D541 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc7Q9D541 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc7Q9D541 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc7Q9D541 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc7Q9D541 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc7Q9D541 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc7Q9D541 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc7Q9D541 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc7Q9D541 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms