Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D4W2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D4W2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D4W2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D4W2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D4W2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D4W2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D4W2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D4W2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D4W2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D4W2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D4W2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D4W2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D4W2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D4W2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D4W2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D4W2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D4W2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D4W2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D4W2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D4W2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D4W2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D4W2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D4W2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D4W2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D4W2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D4W2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D4W2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D4W2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D4W2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D4W2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D4W2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D4W2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D4W2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D4W2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D4W2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D4W2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D4W2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D4W2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D4W2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D4W2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D4W2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D4W2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D4W2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D4W2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D4W2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D4W2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D4W2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D4W2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D4W2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D4W2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D4W2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D4W2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D4W2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D4W2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D4W2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D4W2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D4W2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D4W2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D4W2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D4W2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D4W2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D4W2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D4W2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D4W2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D4W2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D4W2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D4W2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D4W2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D4W2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D4W2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D4W2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D4W2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D4W2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D4W2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D4W2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D4W2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D4W2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D4W2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D4W2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D4W2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D4W2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D4W2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D4W2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D4W2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D4W2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D4W2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D4W2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D4W2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D4W2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D4W2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D4W2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D4W2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D4W2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D4W2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D4W2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D4W2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D4W2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D4W2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D4W2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms