Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc83Q9D4V3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc83Q9D4V3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc83Q9D4V3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc83Q9D4V3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc83Q9D4V3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc83Q9D4V3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc83Q9D4V3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc83Q9D4V3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc83Q9D4V3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc83Q9D4V3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc83Q9D4V3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc83Q9D4V3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc83Q9D4V3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc83Q9D4V3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc83Q9D4V3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc83Q9D4V3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc83Q9D4V3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc83Q9D4V3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc83Q9D4V3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc83Q9D4V3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc83Q9D4V3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc83Q9D4V3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc83Q9D4V3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc83Q9D4V3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc83Q9D4V3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc83Q9D4V3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc83Q9D4V3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc83Q9D4V3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc83Q9D4V3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc83Q9D4V3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc83Q9D4V3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc83Q9D4V3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc83Q9D4V3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc83Q9D4V3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc83Q9D4V3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc83Q9D4V3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc83Q9D4V3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc83Q9D4V3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc83Q9D4V3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc83Q9D4V3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc83Q9D4V3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc83Q9D4V3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc83Q9D4V3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc83Q9D4V3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc83Q9D4V3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc83Q9D4V3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms