Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H8

Cul2, Cullin-2, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul2Q9D4H8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cul2Q9D4H8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cul2Q9D4H8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cul2Q9D4H8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cul2Q9D4H8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cul2Q9D4H8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cul2Q9D4H8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cul2Q9D4H8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cul2Q9D4H8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cul2Q9D4H8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cul2Q9D4H8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cul2Q9D4H8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cul2Q9D4H8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cul2Q9D4H8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cul2Q9D4H8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cul2Q9D4H8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cul2Q9D4H8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cul2Q9D4H8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cul2Q9D4H8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cul2Q9D4H8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cul2Q9D4H8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cul2Q9D4H8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cul2Q9D4H8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cul2Q9D4H8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cul2Q9D4H8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cul2Q9D4H8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cul2Q9D4H8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cul2Q9D4H8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cul2Q9D4H8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cul2Q9D4H8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Cul2Q9D4H8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cul2Q9D4H8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cul2Q9D4H8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cul2Q9D4H8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cul2Q9D4H8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cul2Q9D4H8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cul2Q9D4H8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cul2Q9D4H8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cul2Q9D4H8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cul2Q9D4H8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cul2Q9D4H8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cul2Q9D4H8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cul2Q9D4H8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cul2Q9D4H8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cul2Q9D4H8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cul2Q9D4H8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cul2Q9D4H8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cul2Q9D4H8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cul2Q9D4H8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cul2Q9D4H8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cul2Q9D4H8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cul2Q9D4H8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cul2Q9D4H8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cul2Q9D4H8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cul2Q9D4H8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cul2Q9D4H8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cul2Q9D4H8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cul2Q9D4H8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cul2Q9D4H8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cul2Q9D4H8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cul2Q9D4H8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cul2Q9D4H8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cul2Q9D4H8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cul2Q9D4H8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cul2Q9D4H8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cul2Q9D4H8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cul2Q9D4H8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cul2Q9D4H8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cul2Q9D4H8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cul2Q9D4H8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cul2Q9D4H8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cul2Q9D4H8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cul2Q9D4H8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cul2Q9D4H8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cul2Q9D4H8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cul2Q9D4H8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cul2Q9D4H8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cul2Q9D4H8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cul2Q9D4H8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cul2Q9D4H8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cul2Q9D4H8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cul2Q9D4H8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cul2Q9D4H8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cul2Q9D4H8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cul2Q9D4H8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cul2Q9D4H8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cul2Q9D4H8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cul2Q9D4H8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cul2Q9D4H8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cul2Q9D4H8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cul2Q9D4H8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cul2Q9D4H8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cul2Q9D4H8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cul2Q9D4H8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cul2Q9D4H8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cul2Q9D4H8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cul2Q9D4H8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cul2Q9D4H8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cul2Q9D4H8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cul2Q9D4H8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms