Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pabpc6Q9D4E6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pabpc6Q9D4E6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pabpc6Q9D4E6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pabpc6Q9D4E6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pabpc6Q9D4E6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pabpc6Q9D4E6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pabpc6Q9D4E6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pabpc6Q9D4E6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pabpc6Q9D4E6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pabpc6Q9D4E6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pabpc6Q9D4E6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pabpc6Q9D4E6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pabpc6Q9D4E6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pabpc6Q9D4E6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pabpc6Q9D4E6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pabpc6Q9D4E6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pabpc6Q9D4E6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pabpc6Q9D4E6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pabpc6Q9D4E6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pabpc6Q9D4E6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pabpc6Q9D4E6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pabpc6Q9D4E6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pabpc6Q9D4E6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pabpc6Q9D4E6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pabpc6Q9D4E6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pabpc6Q9D4E6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pabpc6Q9D4E6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pabpc6Q9D4E6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pabpc6Q9D4E6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pabpc6Q9D4E6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pabpc6Q9D4E6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pabpc6Q9D4E6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pabpc6Q9D4E6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pabpc6Q9D4E6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pabpc6Q9D4E6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pabpc6Q9D4E6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pabpc6Q9D4E6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pabpc6Q9D4E6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pabpc6Q9D4E6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pabpc6Q9D4E6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pabpc6Q9D4E6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pabpc6Q9D4E6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pabpc6Q9D4E6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Pabpc6Q9D4E6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pabpc6Q9D4E6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pabpc6Q9D4E6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pabpc6Q9D4E6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pabpc6Q9D4E6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pabpc6Q9D4E6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pabpc6Q9D4E6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pabpc6Q9D4E6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pabpc6Q9D4E6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pabpc6Q9D4E6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pabpc6Q9D4E6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pabpc6Q9D4E6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pabpc6Q9D4E6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pabpc6Q9D4E6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pabpc6Q9D4E6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pabpc6Q9D4E6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pabpc6Q9D4E6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pabpc6Q9D4E6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pabpc6Q9D4E6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pabpc6Q9D4E6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pabpc6Q9D4E6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pabpc6Q9D4E6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pabpc6Q9D4E6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pabpc6Q9D4E6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pabpc6Q9D4E6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pabpc6Q9D4E6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pabpc6Q9D4E6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pabpc6Q9D4E6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pabpc6Q9D4E6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pabpc6Q9D4E6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pabpc6Q9D4E6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Pabpc6Q9D4E6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pabpc6Q9D4E6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pabpc6Q9D4E6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pabpc6Q9D4E6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pabpc6Q9D4E6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pabpc6Q9D4E6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pabpc6Q9D4E6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Pabpc6Q9D4E6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pabpc6Q9D4E6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pabpc6Q9D4E6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pabpc6Q9D4E6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pabpc6Q9D4E6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pabpc6Q9D4E6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pabpc6Q9D4E6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pabpc6Q9D4E6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pabpc6Q9D4E6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pabpc6Q9D4E6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pabpc6Q9D4E6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pabpc6Q9D4E6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pabpc6Q9D4E6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pabpc6Q9D4E6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pabpc6Q9D4E6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pabpc6Q9D4E6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pabpc6Q9D4E6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Pabpc6Q9D4E6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms