Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W4

Gpn3, GPN-loop GTPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpn3Q9D3W4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gpn3Q9D3W4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gpn3Q9D3W4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gpn3Q9D3W4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gpn3Q9D3W4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gpn3Q9D3W4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gpn3Q9D3W4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gpn3Q9D3W4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gpn3Q9D3W4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gpn3Q9D3W4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gpn3Q9D3W4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gpn3Q9D3W4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gpn3Q9D3W4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gpn3Q9D3W4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gpn3Q9D3W4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gpn3Q9D3W4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gpn3Q9D3W4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gpn3Q9D3W4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gpn3Q9D3W4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gpn3Q9D3W4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gpn3Q9D3W4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gpn3Q9D3W4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Gpn3Q9D3W4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gpn3Q9D3W4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gpn3Q9D3W4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gpn3Q9D3W4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gpn3Q9D3W4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gpn3Q9D3W4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gpn3Q9D3W4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gpn3Q9D3W4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gpn3Q9D3W4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gpn3Q9D3W4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gpn3Q9D3W4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gpn3Q9D3W4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gpn3Q9D3W4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gpn3Q9D3W4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gpn3Q9D3W4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gpn3Q9D3W4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gpn3Q9D3W4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gpn3Q9D3W4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gpn3Q9D3W4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gpn3Q9D3W4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gpn3Q9D3W4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gpn3Q9D3W4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gpn3Q9D3W4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gpn3Q9D3W4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gpn3Q9D3W4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Gpn3Q9D3W4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gpn3Q9D3W4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gpn3Q9D3W4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gpn3Q9D3W4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gpn3Q9D3W4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gpn3Q9D3W4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gpn3Q9D3W4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gpn3Q9D3W4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gpn3Q9D3W4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gpn3Q9D3W4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gpn3Q9D3W4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gpn3Q9D3W4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Gpn3Q9D3W4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gpn3Q9D3W4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpn3Q9D3W4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpn3Q9D3W4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpn3Q9D3W4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpn3Q9D3W4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpn3Q9D3W4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpn3Q9D3W4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpn3Q9D3W4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpn3Q9D3W4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpn3Q9D3W4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpn3Q9D3W4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpn3Q9D3W4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpn3Q9D3W4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpn3Q9D3W4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpn3Q9D3W4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpn3Q9D3W4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gpn3Q9D3W4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gpn3Q9D3W4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gpn3Q9D3W4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gpn3Q9D3W4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gpn3Q9D3W4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gpn3Q9D3W4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gpn3Q9D3W4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gpn3Q9D3W4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Gpn3Q9D3W4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gpn3Q9D3W4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gpn3Q9D3W4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gpn3Q9D3W4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gpn3Q9D3W4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gpn3Q9D3W4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gpn3Q9D3W4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gpn3Q9D3W4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gpn3Q9D3W4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gpn3Q9D3W4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gpn3Q9D3W4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gpn3Q9D3W4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gpn3Q9D3W4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gpn3Q9D3W4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gpn3Q9D3W4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gpn3Q9D3W4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms